Кластерная система. Для начинающих пользователей вычислительных кластеров

30.10.2019 Мониторы

Кластер (компьютеры)

Классификация кластеров

Кластеры высокой доступности

Обозначаются аббревиатурой HA (англ. High Availability - высокая доступность). Создаются для обеспечения высокой доступности сервиса, предоставляемого кластером. Избыточное число узлов, входящих в кластер, гарантирует предоставление сервиса в случае отказа одного или нескольких серверов. Типичное число узлов - два, это минимальное количество, приводящее к повышению доступности. Создано множество программных решений для построения такого рода кластеров. В частности, для GNU/Linux , Solaris существует проект бесплатного ПО Linux-HA .

Кластеры распределения нагрузки

Принцип их действия строится на распределении запросов через один или несколько входных узлов, которые перенаправляют их на обработку в остальные, вычислительные узлы. Первоначальная цель такого кластера - производительность, однако, в них часто используются также и методы, повышающие надёжность. Подобные конструкции называются серверными фермами . Программное обеспечение (ПО) может быть как коммерческим (OpenVMS Cluster, Platform LSF HPC, Sun Grid Engine, Moab Cluster Suite, Maui Cluster Scheduler), так и бесплатным (Linux Virtual Server, Mosix).

Вычислительные кластеры

Кластеры используются в вычислительных целях, в частности в научных исследованиях. Для вычислительных кластеров существенными показателями являются высокая производительность процессора на операциях над числами с плавающей точкой (Flops) и низкая латентность объединяющей сети, и менее существенными - скорость операций ввода-вывода, которая в большей степени важна для баз данных и web-сервисов . Вычислительные кластеры позволяют уменьшить время расчетов, по сравнению с одиночным компьютером, разбивая задание на параллельно выполняющиеся ветки, которые обмениваются данными по связывающей сети. Одна из типичных конфигураций - набор компьютеров, собранных из общедоступных компонентов, с установленной на них операционной системой Linux, и связанных сетью Myrinet, Beowulf. Специально выделяют высокопроизводительные кластеры (Обозначаются англ. аббревиатурой HPC Cluster - High-performance computing cluster ). Список самых мощных высокопроизводительных компьютеров (также может обозначаться англ. аббревиатурой HPC ) можно найти в мировом рейтинге TOP500 . В России ведется рейтинг самых мощных компьютеров СНГ TOP50 Суперкомпьютеры .

Системы распределенных вычислений (grid)

Такие системы не принято считать кластерами, но их принципы в значительной степени сходны с кластерной технологией. Их также называют grid-системами . Главное отличие - низкая доступность каждого узла, то есть невозможность гарантировать его работу в заданный момент времени (узлы подключаются и отключаются в процессе работы), поэтому задача должна быть разбита на ряд независимых друг от друга процессов. Такая система, в отличие от кластеров, не похожа на единый компьютер, а служит упрощённым средством распределения вычислений. Нестабильность конфигурации, в таком случае, компенсируется большим числом узлов.

Самые производительные

Дважды в год организацией IBM Roadrunner (Лос-Аламосская национальная лаборатория , США , созданный в ), его максимальная производительность (на июль 2008) составляет 1,026 2008) - суперкомпьютер, BlueGene /P находится в Федеративной Республике Германия , в исследовательском центре города Юлих, земля Северный Рейн-Вестфалия, максимально достигнутая производительность 167,3 Висконсин, США).

Сравнительно дешёвую альтернативу суперкомпьютерам представляют кластеры, основанные на концепции Beowulf , которые строятся из обыкновенных недорогих компьютеров на основе бесплатного программного обеспечения. Один из практических примеров такой системы - Stone Soupercomputer (Оак Ридж, шт. Теннесси , США, ).

Крупнейший кластер, принадлежащий частному лицу (из 1000 процессоров), был построен Джоном Козой (John Koza).

История

История создания кластеров неразрывно связана с ранними разработками в области компьютерных сетей. Одной из причин для появления скоростной связи между компьютерами стали надежды на объединение вычислительных ресурсов. В начале 1970-х гг. группой разработчиков протокола TCP/IP и лабораторией Xerox PARC были закреплены стандарты сетевого взаимодействия. Появилась и операционная система Hydra («Гидра») для компьютеров DEC, созданный на этой основе кластер был назван C.mpp (Питтсбург , шт. Пенсильвания , США, ). Тем не менее, только около г. были созданы механизмы, позволяющие с лёгкостью пользоваться распределением задач и файлов через сеть, по большей части это были разработки на основе Sun Microsystems.

Первым коммерческим проектом кластера стал ARCNet, созданный компанией Datapoint в г. Прибыльным он не стал, и поэтому строительство кластеров не развивалось до г., когда DEC построила свой VAXcluster на основе операционной системы HP Alpha и 1994, класс HA) и г. это ПО для объединения компьютеров в виртуальный суперкомпьютер открыло возможность мгновенного создания кластеров. В результате суммарная производительность всех созданных тогда дешёвых кластеров обогнала по производительности сумму мощностей «серьёзных» коммерческих систем.

Создание кластеров на основе дешёвых персональных компьютеров, объединённых сетью передачи данных, продолжилось в г. силами Американского аэрокосмического агентства (NASA), затем в г. получили развитие кластеры Beowulf , специально разработанные на основе этого принципа. Успехи таких систем подтолкнули развитие grid-сетей , которые существовали ещё с момента создания

Программные средства

Широко распространённым средством для организации межсерверного взаимодействия является библиотека MPI , поддерживающая языки и Fortran . Она используется, например, в программе моделирования погоды MM5 .

Компанией Windows. Он создан на основе технологии, выкупленной у Digital Equipment Corporation , поддерживает до 8 узлов в кластере, а также работу в сети SAN . Набор API-интерфейсов служит для поддержки распределяемых приложений, есть заготовки для работы с программами, не предусматривающими работы в кластере.

См. также

Ссылки

  • Вычислительный кластер Киевского национального университета им. Т. Г. Шевченка
  • Высокопроизводительные вычисления на Nvidia GPU, проект Tesla

Wikimedia Foundation . 2010 .

Blue Gene /L и семейства SGI Altix.

В качестве базового программного обеспечения для организации вычислений на кластерных системах рассматривается Windows Compute Cluster Server ( CCS ) 2003. Дается его общая характеристика и состав сервисов, работающих на узлах кластеров.

В заключение данного раздела, приводятся правила работы с консолью запуска и управления заданиями CCS . Описываются подробности работы планировщика CCS при исполнении последовательностей заданий на кластере.

1.1. Архитектура высокопроизводительных процессоров и кластерных систем

В истории развития архитектуры компьютерных процессоров можно выделить два крупных этапа:

  • 1-й этап - увеличение тактовой частоты работы процессоров (до 2000 г.),
  • 2-й этап - появление многоядерных процессоров (после 2000) г.

Таким образом, подход на основе SMP ( Symmetrical MultiProcessing ), который развивался при построении высокопроизводительных серверов, в которых несколько процессоров разделяют ресурс системы, и, в первую очередь , оперативную память (см. Рис 1.1), сместился "вниз" на уровень ядер внутри процессора.


Рис. 1.1.

На пути к многоядерным процессорам, первой появилась технология Hyper-Threading , впервые примененная в 2002 г. в процессорах Intel Pentium 4:


Рис. 1.2.

В этой технологии два виртуальных процессора разделяют между собой все ресурсы одного физического процессора, а именно, кэши, конвейер исполнения и отдельные исполнительные устройства. При этом, если один виртуальный процессор занял общий ресурс , то второй будет ожидать его освобождения. Тем самым, процессор с Hyper-Threading можно сравнить с многозадачной операционной системой, обеспечивающей каждому работающему в ней процессу свой виртуальный компьютер с полным набором средств и занимающейся планированием порядка и времени работы этих процессов на физическом оборудовании. Только в случае с Hyper-Threading , все это происходит на значительно более низком аппаратном уровне. Тем не менее, два потока команд позволяют более эффективно загрузить исполнительные устройства процессора. Реальный прирост производительности процессора от применения технологии Hyper-Threading оценивается от 10 до 20 процентов.

Полноценный двухъядерный процессор (см. Рис 1.3), на отдельных задачах демонстрирует прирост производительности от 80 до 100 процентов.


Рис. 1.3.

Таким образом, двухъядерный и, в общем случае, многоядерный процессор , можно рассматривать как SMP -систему в миниатюре, в которой отсутствует необходимость использования сложных и дорогих многопроцессорных материнских плат.

Более того, каждое ядро может (как, например, в процессоре Intel Pentium Extreme Edition 840) поддерживать технологию Hyper-Threading , а потому такого рода двухъядерный процессор может выполнять четыре программных потока одновременно.

В начале 2007 г., корпорация Intel представила 80-ядерный однокристальный процессор , получивший название Teraflops Research Chip (http://www.intel.com/research/platform/terascale/teraflops.htm). Этот процессор может достигать производительности 1,01 терафлопс при минимальной тактовой частоте ядра 3,16 ГГц и напряжении 0,95 В. При этом общее энергопотребление чипа составляет всего 62 Вт.

По прогнозам Intel, коммерческие варианты процессоров с большим числом ядер появятся в ближайшие 5 лет, а к 2010 г. четверть объема всех поставляемых серверов будут иметь терафлопную производительность .

Кластерные вычислительные системы и их архитектура

Кластер - это локальная (расположенная территориально в одном месте) вычислительная система, состоящая из множества независимых компьютеров и сети, связывающей их. Кроме того, кластер является локальной системой потому, что он управляется в рамках отдельного административного домена как единая компьютерная система.

Компьютерные узлы из которых он состоит, являются стандартными, универсальными (персональными) компьютерами, используемыми в различных областях и для разнообразных приложений. Вычислительный узел может содержать либо один микропроцессор, либо несколько, образуя, в последнем случае, симметричную (SMP-) конфигурацию.

Сетевая компонента кластера может быть либо обычной локальной сетью, либо быть построена на основе специальных сетевых технологий, обеспечивающих сверхбыструю передачу данных между узлами кластера. Сеть кластера предназначена для интеграции узлов кластера и, обычно, отделена от внешней сети, через которую осуществляется доступ пользователей к кластеру.

Программное обеспечение кластеров состоит из двух компонент:

  • средств разработки/программирования и
  • средств управления ресурсами.

К средствам разработки относятся компиляторы для языков, библиотеки различного назначения, средства измерения производительности, а также отладчики, что, всё вместе, позволяет строить параллельные приложения.

К программному обеспечению управления ресурсами относятся средства инсталляции, администрирования и планирования потоков работ.

Хотя для параллельной обработки существует очень много моделей программирования, но, на настоящий момент, доминирующим подходом является модель на основе "передачи сообщений" ( message passing ), реализованная в виде стандарта MPI ( Message Passing Interface). MPI - это библиотека функций, с помощью которых в программах на языках C или Фортран можно передавать сообщения между параллельными процессами, а также управлять этими процессами.

Альтернативами такому подходу являются языки на основе так называемого "глобального распределенного адресного пространства" (GPAS - global partitioned address space), типичными представителями которых являются языки HPF (High Performance Fortran) и UPC (Unified Parallel C).

Вершина современной инженерной мысли - сервер Hewlett-Packard Integrity Model SD64A. Огромная SMP-система, объединяющая в себе 64 процессора Intel Itanium 2 с частотой 1,6 ГГц и 256 Гбайт оперативной памяти, колоссальная производительность, внушительная цена - 6,5 млн. долларов…

Вершина современной инженерной мысли - сервер Hewlett-Packard Integrity Model SD64A. Огромная SMP-система, объединяющая в себе 64 процессора Intel Itanium 2 с частотой 1,6 ГГц и 256 Гбайт оперативной памяти, колоссальная производительность, внушительная цена - 6,5 млн. долларов…

Нижняя строчка свежего рейтинга пятисот самых быстрых компьютеров мира: принадлежащий группе компаний SunTrust Banks Florida кластер на основе блейд-серверов HP ProLiant BL-25p. 480 процессоров Intel Xeon 3,2 ГГц; 240 Гбайт оперативной памяти. Цена - меньше миллиона долларов.

Как-то странно получается, согласитесь: шесть с половиной миллионов долларов за 64-процессорный сервер и вдесятеро меньше - за примерно аналогичный по объему памяти и дисковой подсистеме, но уже 480-процессорный суперкомпьютер, причем от того же самого производителя. Впрочем, странно это только на первый взгляд: общего у двух компьютеров совсем немного. SD64A - представитель "классического" направления симметричной многопроцессорности (SMP), хорошо знакомого нам по обычным серверам и многоядерным системам, позволяющий использовать "традиционное" параллельное ПО. Это кучка процессоров, много оперативной памяти и очень сложная система, сводящая их (и периферию сервера) в единое целое; причем даже весьма недешевые процессоры (по четыре тысячи долларов за каждый) и огромный объем оперативной памяти (по двести долларов за каждый гигабайт) - лишь малая часть стоимости этой "объединяющей" части сервера. Машина же SunTrust Bank Florida - представитель современного "кластерного" направления и по сути - просто набор соединенных в Ethernet-сеть обычных "недорогих" (по паре тысяч долларов за штуку) компьютеров. Серверная стойка, набор кабелей, система питания и охлаждения - вот и все, что эти компьютеры объединяет.

Что такое кластер?

Стандартное определение таково: кластер - это набор вычислительных узлов (вполне самостоятельных компьютеров), связанных высокоскоростной сетью (интерконнектом) и объединенных в логическое целое специальным программным обеспечением. Фактически простейший кластер можно собрать из нескольких персоналок, находящихся в одной локальной сети, просто установив на них соответствующее ПО[Всех желающих сделать это самостоятельно отсылаем к статье Михаила Попова "Еда и кластеры на скорую руку" (offline.computerra.ru/2002/430/15844), которая до сих пор актуальна]. Однако подобные схемы - скорее редкость, нежели правило: обычно кластеры (даже недорогие) собираются из специально выделенных для этой цели компьютеров и связываются друг с другом отдельной локальной сетью.

В чем идея подобного объединения? Кластеры ассоциируются у нас с суперкомпьютерами, круглые сутки решающими на десятках, сотнях и тысячах вычислительных узлов какую-нибудь сверхбольшую задачу, но на практике существует и множество куда более "приземленных" кластерных применений. Часто встречаются кластеры, в которых одни узлы, дублируя другие, готовы в любой момент перехватить управление, или, например, одни узлы, проверяя получаемые с другого узла результаты, радикально повышают надежность системы. Еще одно популярное применение кластеров - решение задачи массового обслуживания, когда серверу приходится отвечать на большое количество независимых запросов, которые можно легко раскидать по разным вычислительным узлам[Обычно эту штуку называют серверной фермой, именно по такому принципу работает Google]. Однако рассказывать об этих двух, если угодно, "вырожденных" случаях кластерных систем практически нечего - из их краткого описания и так ясно, как они работают; поэтому разговор наш пойдет именно о суперкомпьютерах.
Итак, суперкомпьютер-кластер. Он состоит из трех основных компонентов: собственно "вычислялок" - компьютеров, образующих узлы кластера; интерконнекта, соединяющего эти узлы в сеть, и программного обеспечения, заставляющего всю конструкцию "почувствовать" себя единым компьютером. В роли вычислительных узлов может выступать что угодно - от старой никому не нужной персоналки до современного четырехпроцессорного сервера, причем их количество ничем не ограниченно (ну разве что площадью помещения да здравым смыслом). Чем быстрее и чем больше - тем лучше; и как эти узлы устроены, тоже неважно[Обычно для упрощения решения и непростой задачи балансировки нагрузки на разные узлы кластера все узлы в кластере делают одинаковыми, но даже это требование не абсолютно]. Гораздо интереснее обстоят дела с интерконнектом и программным обеспечением.

Как устроен кластер?

История развития кластерных систем неразрывно связана с развитием сетевых технологий. Дело в том, что, чем больше элементов в кластере и чем они быстрее, (и, соответственно, чем выше быстродействие всего кластера), тем более жесткие требования предъявляются к скорости интерконнекта. Можно собрать кластерную систему хоть из 10 тысяч узлов, но если вы не обеспечите достаточной скорости обмена данными, то производительность компьютера по-прежнему оставит желать лучшего. А поскольку кластеры в высокопроизводительных вычислениях - это практически всегда суперкомпьютеры[Программирование для кластеров - весьма трудоемкая задача, и если есть возможность обойтись обычным сервером SMP-архитектуры с эквивалентной производительностью, то так и предпочитают делать. Поэтому кластеры используются только там, где SMP обходится слишком дорого, а со всех практических точек зрения требующие такого количества ресурсов машины - это уже суперкомпьютеры], то и интерконнект для них просто обязан быть очень быстрым, иначе полностью раскрыть свои возможности кластер не сможет. В результате практически все известные сетевые технологии хотя бы раз использовались для создания кластеров[Я даже слышал о попытках использования в качестве интерконнекта стандартных портов USB], причем разработчики зачастую не ограничивались стандартом и изобретали "фирменные" кластерные решения, как, например, интерконнект, основанный на нескольких линиях Ethernet, включаемых между парой компьютеров в параллель. К счастью, с повсеместным распространением гигабитных сетевых карт, ситуация в этой области становится проще[Почти половину списка суперкомпьютеров Top 500 составляют кластеры, построенные на основе Gigabit Ethernet], - они довольно дешевы, и в большинстве случаев предоставляемых ими скоростей вполне достаточно.

Вообще, по пропускной способности интерконнект почти дошел до разумного предела: так, постепенно появляющиеся на рынке 10-гигабитные адаптеры Ethernet вплотную подобрались к скоростям внутренних шин компьютера, и если создать некий гипотетический 100-гигабитный Ethernet, то не найдется ни одного компьютера, способного пропустить через себя такой огромный поток данных. Но на практике десятигигабитная локальная сеть, несмотря на всю свою перспективность, встречается редко - технология Ethernet допускает использование только топологии "звезда", а в подобной системе центральный коммутатор, к которому подключаются все остальные элементы, обязательно будет узким местом. Кроме того, у Ethernet-сетей довольно большая латентность[Время между отправкой запроса одним узлом и получением этого запроса другим узлом], что тоже затрудняет их использование в "тесно связанных" задачах, где отдельные вычислительные узлы должны активно обмениваться информацией. Поэтому несмотря на почти предельную пропускную способность Ethernet-решений в кластерах широко используются сети со специфической топологией - старая добрая Myrinet, дорогая элитная Quadrics, новенькая InfiniBand и др. Все эти технологии "заточены" под распределенные приложения и обеспечивают минимальную латентность исполнения команд и максимальную производительность. Вместо традиционной "звезды" здесь из вычислительных элементов строятся плоские и пространственные решетки, многомерные гиперкубы, поверхности трехмерного тора и другие "топологически хитрые" объекты. Такой подход позволяет одновременно передавать множество данных по сети, гарантируя отсутствие узких мест и увеличивая суммарную пропускную способность.

Как развитие идей быстрого интерконнекта отметим, например, адаптеры сети InfiniBand, подключающиеся через специальный слот HTX к процессорной шине HyperTransport. Фактически адаптер напрямую подключается к процессору[Напомним, что в многопроцессорных системах на базе AMD Opteron межпроцессорное взаимодействие происходит именно по этой шине]! Лучшие образцы подобных решений обеспечивают столь высокую производительность, что построенные на их основе кластеры вплотную приближаются по характеристикам к классическим SMP-системам, а то и превосходят их. Так, в ближайшие несколько месяцев на рынке должен появиться интереснейший чип под названием Chorus, который по четырем шинам HyperTransport подключается к четырем или двум процессорам AMD Opteron, расположенным на одной с ним материнской плате, и с помощью трех линков InfiniBand может подключаться еще к трем другим "Хорусам", контролирующим другие четверки (или пары) процессоров. Один Chorus - это одна материнская плата и один сравнительно независимый узел с несколькими процессорами, подключаемый стандартными кабелями InfiniBand к остальным узлам. Внешне вроде бы получается кластер, но - только внешне: оперативная память у всех материнских плат общая. Всего в текущем варианте может объединяться до восьми "Хорусов" (и соответственно до 32 процессоров), причем все процессоры будут работать уже не как кластер, а как единая SUMA-система, сохраняя, однако, главное достоинство кластеров - невысокую стоимость и возможность наращивания мощности. Такой вот получается "суперкластеринг", стирающий границы между кластерами и SMP.

Впрочем, все эти новомодные решения совсем не дешевы, - а ведь начинали мы с невысокой себестоимости кластера. Поэтому "Хорусы" да "Инфинибенды", стоящие солидных денег (несколько тысяч долларов на каждый узел кластера, что хоть и гораздо меньше, чем у аналогичных SMP-систем, но все равно дорого), встречаются нечасто. В секторе "академических" суперкомпьютеров, принадлежащих университетам, обычно используются самые дешевые решения, так называемые Beowulf–кластеры, состоящие из набора персоналок, соединенных гигабитной или даже стомегабитной Ethеrnet-сетью и работающих под управлением бесплатных операционных систем типа Linux. Несмотря на то что собираются такие системы буквально "на коленке", иногда из них все равно вырастают сенсации: к примеру, "биг-мак" - собранный из 1100 обычных "макинтошей" самодельный кластер, обошедшийся организаторам всего в 5,2 млн. долларов и умудрившийся занять в 2003 году третье место в рейтинге Top 500.

GRID-сети

Можно ли "продолжить" кластеры в сторону меньшей связанности точно так же, как, "продолжив" их в другом направлении, мы пришли к чипу Chorus и "почти SMP"? Можно! При этом мы отказываемся от построения специальной кластерной сети, а пытаемся использовать уже имеющиеся ресурсы - локальные сети и образующие их компьютеры. Общее название подобного рода решений - GRID-технологии, или технологии распределенных вычислений (вы наверняка с ними хорошо знакомы по таким проектам, как Distributed.Net или SETI@Home; машины добровольцев, участвующих в этих проектах, загружены разнообразными расчетами, ведущимися в то время, когда ПК хозяину не нужен). Ограничиваться достигнутым создатели GRID-систем не собираются и ставят перед собой амбициозную цель - сделать вычислительные мощности таким же доступным ресурсом, как электричество или газ в квартире. В идеале все компьютеры, подключенные к Интернету в рамках GRID, должны быть объединены в некое подобие кластера, и в то время, когда ваша машина простаивает, ее ресурсы будут доступны другим пользователям, а когда у вас возникает необходимость в больших мощностях, вам помогают "чужие" свободные компьютеры, которых в Сети предостаточно (кто-то отошел попить кофе, кто-то занимается серфингом или другими не загружающими процессор делами). Приоритетный доступ к ресурсам GRID будут иметь ученые, которые получат в распоряжение в буквальном смысле всемирный суперкомпьютер; но и обычные пользователи тоже внакладе не останутся.

Впрочем, если на словах все выглядит так замечательно, то почему это светлое будущее до сих пор не настало? Все дело в том, что при создании GRID возникают нетривиальные проблемы, решать которые пока никто толком не научился. В отличие от простого кластера при создании подобной системы приходится учитывать такие факторы, как неоднородность вычислительных узлов, низкая пропускная способность и нестабильность каналов, куда большее количество одновременно выполняемых задач, непредсказуемое поведение элементов системы, ну и, конечно, недоброжелательность некоторых пользователей. Судите сами: неоднородность нашей сети (причем очень сильная) возникает оттого, что к Интернету подключены самые разные компьютеры; у них разные возможности, разные линии связи и разные хозяева (режим работы у каждого свой). К примеру, где-то в школе есть гигабитная сеть из трех десятков почти всегда доступных, но не очень быстрых компьютеров, выключающихся на ночь в строго определенное время; а где-то стоит одинокий компьютер с завидной производительностью, непредсказуемо подключаемый к Сети по слабенькому дайлапу: так вот, в первом случае будут очень хорошо выполняться одни задачи, а во втором - совершенно другие. И для обеспечения высокой производительности системы в целом все это надо как-то анализировать и прогнозировать, чтобы оптимальным образом спланировать выполнение различных операций.

Далее. С плохими каналами связи трудно что-то сделать, но ведь можно не ждать светлого будущего, когда Интернет станет быстрым и надежным, а уже сейчас применять действенные методы сжатия и контроля целостности передаваемой информации. Вполне возможно, что резко повысившаяся за счет этого пропускная способность каналов скомпенсирует выросшую из-за необходимости сжатия и контроля вычислительную нагрузку на компьютеры сети.

К сожалению, большое количество одновременно выполняемых задач существенно увеличивает нагрузку на управляющие элементы GRID-сети и осложняет задачу эффективного планирования, поскольку уже сами "управленцы", контролирующие эту сеть, зачастую начинают требовать для себя отдельный суперкомпьютер, ссылаясь на необходимость сложного контроля и планирования. А планировать и осуществлять контроль им действительно нелегко, и не только из-за неоднородности планируемых ресурсов, но и по причине их "ненадежности". Вот, к примеру, непредсказуемое поведение хозяина компьютера - это отдельная песня. В обычном кластере выход элемента из строя - нештатная ситуация, которая влечет за собой остановку вычислений и ремонтные работы, в GRID же отказ одного элемента - нормальная ситуация (почему бы не выключить компьютер, когда вам это надо?), ее нужно корректно обработать и передать невыполненное задание на другой узел или же заранее назначать одно и то же задание нескольким узлам.

И наконец, никуда не деться в GRID-сетях от недоброжелательных пользователей (не зря же сейчас очень много делается для защиты информации). Ведь нам нужно как-то распределять и планировать во всей сети задания от всех ее пользователей, - и мало ли чего какой-нибудь Василий Пупкин мог туда запустить? Сегодня и без того вирусы, заражающие подключенные к Интернету компьютеры специальными троянами ("зомбирование") и создающие целые "зомби-сети" из зараженных машин, готовых делать все, что заблагорассудится автору вируса (проводить ли распределенные DDoS-атаки или рассылать спам - неважно), представляют собой серьезнейшую угрозу, а тут - у любого человека появляется возможность посредством штатной системы рассылки распространить любой код на сотни и тысячи персоналок. И хотя эта проблема в принципе решаема (например, путем создания для выполняемых задач виртуальных машин - благо вскоре технологии аппаратной виртуализации , которые позволят это сделать без особого труда, станут штатной принадлежностью большинства новых компьютеров), то как защититься от банальной "шалости" в виде запуска бессмысленного кода (скажем, бесконечного цикла) и замусоривания им GRID-сети?

На самом деле все не так грустно, и многое в GRID-направлении уже сделано. Запущены и функционируют десятки проектов, использующих распределенные вычисления для научных и околонаучных целей; запущены и GRID-сети для "внутриуниверситетского" научного использования - в частности, CrossGrid, DataGrid и EUROGRID.

Программное обеспечение для кластеров

А вот здесь все очевидно и просто: фактически на протяжении последних пяти лет для кластерных вычислений существует один-единственный стандарт - MPI (Message Passing Interface). Программы, написанные с использованием MPI, абсолютно переносимы - их можно запускать и на SMP-машине, и на NUMA, и на любой разновидности кластера, и на GRID-сети, причем из любой операционной системы. Конкретных реализаций MPI довольно много (к примеру, каждый поставщик "фирменного" быстрого интерконнекта может предлагать свой вариант MPI-библиотеки для его решения), однако благодаря совместимости выбирать из них можно любой, какой вам приглянется (например, быстродействием или удобством настройки). Очень часто используется такой OpenSource-проект, как MPICH, обеспечивающий работу на более чем двух десятках различных платформ, включая самые популярные - SMP (межпроцессное взаимодействие через разделяемую память) и кластеры с интерконнектом Ethernet (межпроцессное взаимодействие поверх протокола TCP/IP), - если доведется когда-нибудь настраивать кластер, то начать советую именно с него.

На "классических" SMP-системах и некоторых NUMA’х реализация параллельных вычислений с использованием MPI заметно уступает по производительности более "аппаратно ориентированным" многопоточным приложениям, поэтому наряду с "чистыми" MPI-решениями встречаются "гибриды", в которых на кластере "в целом" программа работает с использованием MPI, но на каждом конкретном узле сети (а каждый узел кластера - это зачастую SMP-система) работает MPI-процесс, распараллеленный вручную на несколько потоков. Как правило, это гораздо эффективнее, но и гораздо труднее в реализации, а потому на практике встречается нечасто.

Как уже говорилось, можно выбрать практически любую операционную систему. Традиционно для создания кластеров используется Linux (более 70% систем Top 500) или другие разновидности Unix (оставшиеся 30%), однако последнее время к этому престижному рынку HPC (High Perfomance Computing) присматривается и Microsoft, выпустившая бета-версию Windows Compute Claster Server 2003[Бесплатно скачать эту бету можно ], в состав которой включена микрософтовская версия библиотеки MPI - MSMPI. Так что организация "кластера своими руками" вскоре может стать уделом не только юниксоидов, но и их менее знающих собратьев-администраторов, да и вообще - значительно упроститься.

Напоследок скажем, что кластерные вычисления годятся далеко не для всяких задач. Во-первых, программы под кластерные вычисления нужно "затачивать" вручную, самостоятельно планируя и маршрутизируя потоки данных между отдельными узлами. MPI, правда, сильно упрощает разработку параллельных приложений в том плане, что в нем при понимании сути происходящего соответствующий код очень нагляден и очевиден, и традиционные глюки параллельных программ типа дедлоков или параллельного использования ресурсов практически не возникают. Но вот заставить получающийся код быстро работать на MPI бывает довольно трудно - зачастую для этого приходится серьезно модифицировать сам программируемый алгоритм. В целом нераспараллеливающиеся и труднораспараллеливающиеся программы на MPI реализуются плохо; а все остальные - более или менее хорошо (в смысле - масштабируются до десятков, а в "хорошем" случае - и до тысяч процессоров). И чем больше степень связанности кластера, тем проще извлекать из него выгоду от параллельной обработки данных: на кластере, связанном сетью Myrinet, программа может работать быстро, а на аналогичном кластере, где интерконнектом выступает Fast Ethernet, - попросту не масштабироваться (не получать дополнительного прироста производительности) сверх десяти процессоров. Особенно трудно получить какой-либо выигрыш в GRID-сетях: там вообще, по большому счету, подходят только слабо связанные задачи с минимумом начальных данных и сильным параллелизмом - например, те, в которых приходится перебирать значительное количество вариантов.

Вот такие они - доступные всем суперкомпьютеры сегодняшнего дня. И не только доступные, но и более чем востребованные повсюду, где требуются высокопроизводительные вычисления за умеренные деньги. Даже простой пользователь, увлекающийся рендерингом, может собрать дома из своих машин небольшой кластер (рендеринг параллелится практически идеально, так что никаких ухищрений здесь не понадобится) и резко увеличить производительность труда[К примеру, пакет Maya позволяет организовать кластерный рендеринг даже без привлечения каких-либо сторонних пакетов и библиотек. Достаточно установить его на несколько компьютеров локальной сети и настроить сервер и несколько клиентов].


кафедра 29 "Управляющие Интеллектуальные Системы"

Реферат на тему:

Кластерные системы

Выполнил:

студент группы К9-292

Попов И.А

МОСКВА 2001

1. Введение

2. Основные классы современных параллельных компьютеров

3. Кластерная архитектура параллельных компьютеров

4. Цели создания кластерных систем

5. Отказоустойчивые кластеры

6. Высокопроизводительные кластеры

7. Проект Beowulf

8. Заключение

9. Литература


Введение

Развитие многопроцессорных вычислительных систем

Развитие традиционных архитектур построения вычислительных систем, таких как SMP, MPP, векторных параллельных систем идет достаточно быстрыми темпами. Повышается производительность, растет надежность и отказоустойчивость. Однако у этих архитектур есть один недостаток - стоимость создаваемых систем, подчас недоступная для многих пользователей таких систем - образовательных и научно-исследовательских организаций. Она оказывает очень высокой из-за усложнения аппаратных и программных составляющих системы, которые требуются для обеспечения таких темпов роста производиельности. Однако потребность в вычислительных ресурсах в настоящее время очень высока во многих сферах научной и практической деятельности и для ее обеспечения не хватает ресурсов традиционных суперкомпьютерных систем.

Кластерные системы возникли как более дешевое решение проблемы недостатка вычислительных ресурсов, и основываются на использовании в своей архитектуре широко распространенных и относительно дешевых технологий, аппаратных и программных средств, таких как PC, Ethernet, Linux и т.д. Использование массовых технологии в кластерных системах стало возможным благодаря значительному прогрессу в развитии компонентов обычных вычислительных систем, таких как центральные процессоры, операционные системы, коммуникационные среды.

Так как кластерные системы архитектурно являются развитием систем с массовым параллелизмом MPP, то главную роль в их развитии является прогресс в области сетевых технологий. К настоящему времени появились недорогие, но эффективные коммуникационные решения. Это и предопределило быстрое появление и развитие кластерных вычислительных систем. Также прогрессу развития кластерных систем способствовали и другие факторы.

Производительность персональных компьютеров на базе процессоров Intel в последние годы также значительно выросла. Такие компьютеры стали создавать серьезную конкуренцию рабочим станциям на базе более дорогих и мощных RISC процессоров. Одновременно стала приобретать все большую популярность ОС Linux - бесплатно распространяемая версия UNIX. При этом в научных организациях и университетах, где и разрабатывается большинство кластерных систем, как правило, имеются специалисты по ОС Linux.

Высокую степень развития кластерных систем на сегоднящний день показывает тот факт, что в списке самых мощных суперкомпьютеров мира Top500 – числится 11 кластерных установок.


Основные классы современных параллельных компьютеров

Кластерные системы являются развитием параллельных систем. Чтобы проказать место кластерных систем среди остальных типов параллельных архитектур вычислительных систем нужно привести их классификацию. Параллельные системы могут быть класифицированы по различным критериям.

С аппаратной точки зрения, основным параметром классификации паралелльных компьютеров является наличие общей (SMP) или распределенной памяти (MPP). Нечто среднее между SMP и MPP представляют собой NUMA-архитектуры, где память физически распределена, но логически общедоступна.

Симметричные мультипроцессорные системы

SMP система состоит из нескольких однородных процессоров и массива общей памяти. Один из часто используемых в SMP архитектурах подходов для формирования масштабируемой, общедоступной системы памяти, состоит в однородной организации доступа к памяти посредством организации масштабируемого канала память-процессоры:

Каждая операция доступа к памяти интерпретируется как транзакция по шине процессоры-память. Когерентность кэшей поддерживается аппаратными средствами.

В SMP каждый процессор имеет по крайней мере одну собственную кэш-память (а возможно, и несколько).

Можно сказать, что SMP система - это один компьютер с несколькими равноправными процессорами. Все остальное - в одном экземпляре: одна память, одна подсистема ввода/вывода, одна операционная система. Слово "равноправный" означает, что каждый процессор может делать все, что любой другой. Каждый процессор имеет доступ ко всей памяти, может выполнять любую операцию ввода/вывода, прерывать другие процессоры и т.д.

Недостатком данной архитектуры является необходимость организации канала процессоры-память с очень высокой пропускной способностью.

Массивно-параллельные системы

Массивно-параллельная система MPP состоит из однородных вычислительных узлов , включающих в себя:

  • один или несколько центральных процессоров (обычно RISC)
  • локальную память (прямой доступ к памяти других узлов невозможен)
  • коммуникационный процессор или сетевой адаптер
  • жесткие диски и/или другие устройства В/В

К системе могут быть добавлены специальные узлы ввода-вывода и управляющие узлы. Узлы связаны через некоторую коммуникационную среду (высокоскоростная сеть, коммутатор и т.п.)

Системы с неоднородным доступом к памяти NUMA

NUMA (nonuniform memory access) в отличие от привычной SMP архитектуры с разделяемой памятью представляет собой несколько отдельных процессоров, каждый из которых, кроме собственного кэша, обладает также локальной памятью:

В подобной архитектуре процессор и модули памяти тесно интегрированы, следовательно, скорость доступа к локальной памяти гораздо выше, чем к памяти “соседнего” процессора. Подсистемы ввода-вывода могут быть частью каждого узла или консолидированы на выделенных узлах ввода-вывода. Если во всей системе поддерживается когерентность кэшей, то такую архитектуру называют cc-NUMA.

Проще всего охарактеризовать NUMA-систему, представив себе большую систему SMP, разделенную на несколько частей, эти части связаны коммуникационной магистралью, подключенной к системным шинам, и каждая часть включает собственную основную память и подсистему ввода/вывода. Это и есть NUMA: большая SMP, разбитая на набор более мелких и простых SMP. Основной проблемой NUMA является обеспечение когерентности кэшей. Аппаратура позволяет работать со всеми отдельными устройствами основной памяти составных частей системы (называемых обычно узлами) как с единой гигантской памятью.

Кластерная архитектура

Рассмотрим место кластерной архитектуры вычислительных систем в данной классификации.

Кластер - это связанный набор полноценных компьютеров, используемый в качестве единого ресурса. Под понятием "полноценный компьютер" понимается завершенная компьютерная система, обладающая всем, что требуется для ее функционирования, включая процессоры, память, подсистему ввода/вывода, а также операционную систему, подсистемы, приложения и т.д. Обычно для этого годятся персональные компьютеры или параллельные системы, которые могут обладать архитектурой SMP и даже NUMA. Кластеры являются слабосвязанными системами, связи узлов используется одна из стандартных сетевых технологий (Fast/Gigabit Ethernet, Myrinet) на базе шинной архитектуры или коммутатора. Поэтому они являются более дешевой в построении модификацией MPP архитектуры.

Кластерная архитектура параллельных компьютеров

Общие принципы

Как уже было сказано раньше вычислительный кластер - это совокупность компьютеров, объединенных в рамках некоторой сети для решения одной задачи (рис.3), которая для пользователя представляется в качестве единого ресурса. Такую концепцию кластера впервые предложила и реализовала в начале 80-х корпорация Digital Equipment, которая и по сей день развивает эту технологию

Понятие "единый ресурс" означает наличие программного обеспечения, дающего возможность пользователям, администраторам и прикладным программам считать, что имеется только одна сущность, с которой они работают - кластер. Например, система пакетной обработки кластера позволяет послать задание на обработку кластеру, а не какому-нибудь отдельному компьютеру. Более сложным примером являются системы баз данных. Практически у всех производителей систем баз данных имеются версии, работающие в параллельном режиме на нескольких машинах кластера. В результате приложения, использующие базу данных, не должны заботиться о том, где выполняется их работа. СУБД отвечает за синхронизацию параллельно выполняемых действий и поддержание целостности базы данных.

Компьютеры, образующие кластер, - так называемые узлы кластера - всегда относительно независимы, что допускает остановку или выключение любого из них для проведения профилактических работ или установки дополнительного оборудования без нарушения работоспособности всего кластера.

В качестве вычислительных узлов в кластере обычно используются однопроцессорные персональные компьютеры, двух- или четырехпроцессорные SMP-серверы. Каждый узел работает под управлением своей копии операционной системы, в качестве которой чаще всего используются стандартные операционные системы: Linux, NT, Solaris и т.п. Состав и мощность узлов может меняться даже в рамках одного кластера, давая возможность создавать неоднородные системы. Выбор конкретной коммуникационной среды определяется многими факторами: особенностями класса решаемых задач, необходимостью последующего расширения кластера и т.п. Возможно включение в конфигурацию специализированных компьютеров, например, файл-сервера, и, как правило, предоставлена возможность удаленного доступа на кластер через Internet.

Из определения архитектуры кластерных систем следует, что она включает в себя очень широкий спектр систем. Рассматривая крайние точки, кластером можно считать как пару ПК, связанных локальной 10-мегабитной сетью Ethernet, так и вычислительную систему, создаваемую в рамках проекта Cplant в Национальной лаборатории Sandia: 1400 рабочих станций на базе процессоров Alpha, связанных высокоскоростной сетью Myrinet.

Таким образом видно, что различных вариантов построения кластеров очень много. При этом в архитектуре кластера большое значение имеют используемые коммуникационные технологии и стандарты. Они во многом определяют круг задач, для решения которых можно использовать кластеры, построенные на основе этих технологий.

Коммуникационные технологии построения кластеров

Кластеры могут стоится как на основе специализированных высокоскоростных шин передачи данных, так и на основе массовых сетевых технологий. Среди массовых коммуникационных стандартов сейчас чаще всего используется сеть Ethernet или более ее производительный вариант - Fast Ethernet, как правило, на базе коммутаторов. Однако большие накладные расходы на передачу сообщений в рамках Fast Ethernet приводят к серьезным ограничениям на спектр задач, которые можно эффективно решать на таком кластере. Если от кластера требуется большая производительность и универсальность, то необходимо применять более скоростные и специализированные технологии. К ним относятся SCI, Myrinet, cLAN, ServerNet и др. Сравнительная характеристика параметров этих технологий приведена в
таблице 1.

Латентность (MPI)

Пропускная способность(MPI)

180 Мбайт/c

Пропускная способность (аппаратная)

400 Мбайт/c

160 Мбайт/c

150 Мбайт/c

12,5 Мбайт/c

Реализация MPI

HPVM, MPICH-GM и др.

Таблица 1.

Производительность коммуникационных сетей в кластерных системах определяется несколькими числовыми характеристиками. Основных характеристик две: латентность – время начальной задержки при посылке сообщений и пропускная способность сети, определяющая скорость передачи информации по каналам связи. При этом важны не столько пиковые характеристики, заявленные в стандарте, сколько реальные, достигаемые на уровне пользовательских приложений, например, на уровне MPI-приложений. В частности, после вызова пользователем функции посылки сообщения Send() сообщение последовательно пройдет через целый набор слоев, определяемых особенностями организации программного обеспечения и аппаратуры, прежде, чем покинуть процессор – поэтому существует существенный разбром по стандартам значений латентности. Наличие латентности приводит к тому, что максимальная скорость передачи по сети не может быть достигнута на сообщениях с небольшой длиной.

Скорость передачи данных по сети в рамках технологий Fast Ethernet и Scalable Coherent Interface (SCI) зависит от длины сообщения. Для Fast Ethernet характерна большая величина латентности – 160-180 мкс, в то время как латентность для SCI это величина около 5,6 мкс. Максимальная скорость передачи для этих же технологий 10 Мбайт/c и 80 Мбайт/с соответственно.

Цели создания кластерных систем

Разработчики архитектур кластерных систем приследовали различные цели при их создании. Первой была фирма Digital Equipment с кластерами VAX/VMS. Целью создания этой машины было повышение надежности работы системы, обеспечение высокой готовности и отказоустойчивости системы. В настоящее время существует множество аналогичных по архитектуре систем от других производителей.

Другой целью создания кластерных систем является создание дешевых высокопроизводительных параллельных вычислительных систем. Один из первых проектов, давший имя целому классу параллельных систем – кластер Beowulf – возник в центре NASA Goddard Space Flight Center для поддержки необходимыми вычислительными ресурсами проекта Earth and Space Sciences. Проект Beowulf начался летом 1994 года, и вскоре был собран 16-процессорный кластер на процессорах Intel 486DX4/100 МГц. На каждом узле было установлено по 16 Мбайт оперативной памяти и по 3 сетевых Ethernet-адаптера. Эта система оказалась очень удачной по отношению цена/производительность, поэтому такую архитектуру стали развивать и широко использовать в других научных организациях и институтах.

Для каждого класса кластеров характерны свои особенности архитекуры и применяемые аппаратные средства. Рассмотрим их более подробно.

Отказоустойчивые кластеры

Принципы построения

Для обеспечения надежности и отказоустойчивости вычислительных систем применяется множество различных аппаратурных и программных решений. Например, в системе может дублироваться все подверженные отказам элементы - источники питания, процессоры, оперативная и внешняя память. Такие отказоустойчивые системы с резервированием компонентов применяются для решения задач, в которых недостаточно надежности обычных вычислительных систем, оцениваемой в настоящий момент вероятностью безотказной работы 99%. В таких задачах требуется вероятность 99,999% и выше. Такую надежность можно достичь применяя отличные от приведенного выше методы повышения отказоустойчивости. В зависимости от уровня готовности вычислительной системы к использованию выделяют четыре типа надежности:

PRIVATEУровень готовности, %

Мaкс. время простоя

Тип системы

3,5 дня в год

Обычная (Conventional)

8,5 часов в год

Высокая надежность (High Availability)

1 час в год

Отказоустойчивая (Fault Resilient)

5 минут в год

Безотказная (Fault Tolerant)

Таблица 2.

В отличие от отказоустойчивых систем с избыточными компонентами, а также различных вариантов многопроцессорности, кластеры объединяют относительно независимые друг от друга машины, каждую из которых можно остановить для профилактики или реконфигурирования, не нарушая при этом работоспособности кластера в целом. Высокая производительность кластера и сведение к минимуму времени простоев приложений достигается благодаря тому, что:

  • в случае сбоя ПО на одном из узлов приложение продолжает функционировать или автоматически перезапускается на других узлах кластера;
  • выход из строя одного из узлов (или нескольких) не приведет к краху всей кластерной системы;
  • профилактические и ремонтные работы, реконфигурацию или смену версий программного обеспечения, как правило, можно осуществлять в узлах кластера поочередно, не прерывая работы других узлов.

Неотъемлемой частью кластера является специальное программное обеспечение, которое, собственно, и решает проблему восстановления узла в случае сбоя, а также решает другие задачи. Кластерное ПО обычно имеет несколько заранее заданных сценариев восстановления работоспособности системы, а также может предоставлять администратору возможности настройки таких сценариев. Восстановление после сбоев может поддерживаться как для узла в целом, так и для отдельных его компонентов - приложений, дисковых томов и т.д. Эта функция автоматически инициируется в случае системного сбоя, а также может быть запущена администратором, если ему, например, необходимо отключить один из узлов для реконфигурации.

Кластеры могут иметь разделяемую память на внешних дисках, как правило, на дисковом массиве RAID. Дисковый массив RAID - это серверная подсистема ввода- вывода для хранения данных большого объема. В массивах RAID значительное число дисков относительно малой емкости используется для хранения крупных объемов данных, а также для обеспечения более высокой надежности и избыточности. Подобный массив воспринимается компьютером как единое логическое устройство.

Восстановление после сбоев может поддерживаться как для узла в целом, так и для отдельных его компонентов - приложений, дисковых томов и т.д. Эта функция автоматически инициируется в случае системного сбоя, а также может быть запущена администратором, если ему, например, необходимо отключить один из узлов для реконфигурации.

Узлы кластера контролируют работоспособность друг друга и обмениваются специфической «кластерной» информацией, например, о конфигурации кластера, а также передавать данные между разделяемыми накопителями и координировать их использование. Контроль работоспособности осуществляется с помощью специального сигнала, который узлы кластера передают друг другу, для того чтобы подтвердить свое нормальное функционирование. Прекращение подачи сигналов с одного из узлов сигнализирует кластерному программному обеспечению о произошедшем сбое и необходимости перераспределить нагрузку на оставшиеся узлы. В качестве примера рассмотрим отказоустойчивый кластер VAX/VMS.

Кластера VAX/VMS

Компания DEC первой анонсировала концепцию кластерной системы в 1983 году, определив ее как группу объединенных между собой вычислительных машин, представляющих собой единый узел обработки информации. По существу VAX-кластер представляет собой слабосвязанную многомашинную систему с общей внешней памятью, обеспечивающую единый механизм управления и администрирования.

VAX-кластер обладает следующими свойствами:

Разделение ресурсов. Компьютеры VAX в кластере могут разделять доступ к общим ленточным и дисковым накопителям. Все компьютеры VAX в кластере могут обращаться к отдельным файлам данных как к локальным.

Высокая готовность. Если происходит отказ одного из VAX-компьютеров, задания его пользователей автоматически могут быть перенесены на другой компьютер кластера. Если в системе имеется несколько контроллеров HSC и один из них отказывает, другие контроллеры HSC автоматически подхватывают его работу.

Высокая пропускная способность. Ряд прикладных систем могут пользоваться возможностью параллельного выполнения заданий на нескольких компьютерах кластера.

Удобство обслуживания системы. Общие базы данных могут обслуживаться с единственного места. Прикладные программы могут инсталлироваться только однажды на общих дисках кластера и разделяться между всеми компьютерами кластера.

Расширяемость. Увеличение вычислительной мощности кластера достигается подключением к нему дополнительных VAX-компьютеров. Дополнительные накопители на магнитных дисках и магнитных лентах становятся доступными для всех компьютеров, входящих в кластер.

Работа VAX-кластера определяется двумя главными компонентами. Первым компонентом является высокоскоростной механизм связи, а вторым - системное программное обеспечение, которое обеспечивает клиентам прозрачный доступ к системному сервису. Физически связи внутри кластера реализуются с помощью трех различных шинных технологий с различными характеристиками производительности.

Основные методы связи в VAX-кластере представлены на рис. 4.

Рис. 4 VAX/VMS-кластер

Шина связи компьютеров CI (Computer Interconnect) работает со скоростью 70 Мбит/с и используется для соединения компьютеров VAX и контроллеров HSC с помощью коммутатора Star Coupler. Каждая связь CI имеет двойные избыточные линии, две для передачи и две для приема, используя базовую технологию CSMA, которая для устранения коллизий использует специфические для данного узла задержки. Максимальная длина связи CI составляет 45 метров. Звездообразный коммутатор Star Coupler может поддерживать подключение до 32 шин CI, каждая из которых предназначена для подсоединения компьютера VAX или контроллера HSC. Контроллер HSC представляет собой интеллектуальное устройство, которое управляет работой дисковых и ленточных накопителей.

Компьютеры VAX могут объединяться в кластер также посредством локальной сети

Ethernet, используя NI - Network Interconnect (так называемые локальные VAX-кластеры), однако производительность таких систем сравнительно низкая из-за необходимости делить пропускную способность сети Ethernet между компьютерами кластера и другими клиентами сети.

Также кластера могут стоиться на основе шины DSSI (Digital Storage System Interconnect). На шине DSSI могут объединяться до четырех компьютеров VAX нижнего и среднего класса. Каждый компьютер может поддерживать несколько адаптеров DSSI. Отдельная шина DSSI работает со скоростью 4 Мбайт/с (32 Мбит/с) и допускает подсоединение до 8 устройств. Поддерживаются следующие типы устройств: системный адаптер DSSI, дисковый контроллер серии RF и ленточный контроллер серии TF. DSSI ограничивает расстояние между узлами в кластере 25 метрами.

Системное программное обеспечение VAX-кластеров

Для гарантии правильного взаимодействия процессоров друг с другом при обращениях к общим ресурсам, таким, например, как диски, компания DEC использует распределенный менеджер блокировок DLM (Distributed Lock Manager). Очень важной функцией DLM является обеспечение когерентного состояния дисковых кэшей для операций ввода/вывода операционной системы и прикладных программ. Например, в приложениях реляционных СУБД DLM несет ответственность за поддержание согласованного состояния между буферами базы данных на различных компьютерах кластера.

Задача поддержания когерентности кэш-памяти ввода/вывода между процессорами в кластере подобна задаче поддержания когерентности кэш-памяти в сильно связанной многопроцессорной системе, построенной на базе некоторой шины. Блоки данных могут одновременно появляться в нескольких кэшах и если один процессор модифицирует одну из этих копий, другие существующие копии не отражают уже текущее состояние блока данных. Концепция захвата блока (владения блоком) является одним из способов управления такими ситуациями. Прежде чем блок может быть модифицирован должно быть обеспечено владение блоком.

Работа с DLM связана со значительными накладными расходами. Накладные расходы в среде VAX/VMS могут быть большими, требующими передачи до шести сообщений по шине CI для одной операции ввода/вывода. Накладные расходы могут достигать величины 20% для каждого процессора в кластере.

Высокопроизводительные кластеры

Принципы построения

Архитектура высокопроизводительных кластеров появилась как развитие принципов построения систем MPP на менее производительных и массовых компонентах, управляемых операционной ситемой общего назначения. Кластеры также как и MPP системы состоят из слабосвязанных узлов, которые могут быть как однородными, так и, в отличие от MPP, различными или гетерогенными. Особое внимание при проектировании высокопроизводительной кластерной архутектуры уделяется обеспечению высокой эффективности коммуникационной шины, связывающей узлы кластера. Так как в кластерах нередко применяются массовые относительно низкопроизводительные шины, то приходится принимать ряд мер по исключению их низкой пропускной способности на производительность кластеров и организацию эффективного распараллеливания в кластере. Так например пропускная способность одной из самых высокоскоростных технологий Fast Ethernet на порядки ниже, чем у межсоединений в современных суперкомпьютерах МРР-архитектуры.

Для решения проблем низкой производительности сети применяют несколько методов:

Кластер разделяется на несколько сегментов, в пределах которых узлы соединены высокопроизводительной шиной типа Myrinet, а связь между узлами разных сегментов осуществляется низкопроизводительными сетями типа Ethernet/Fast Ethernet. Это позволяет вместе с сокращением расходов на коммуникационную среду существенно повысить производительность таких кластеров при решении задач с интенсивным обменом данными между процессами.

IPX). Такой метод часто используют в ситемах класса Beowulf.

Основным качеством, которым должен обладать высокопроизводительный кластер являтся горизонтальная масштабируемость, так как одним из главных преимуществ, которые предоставляет кластерная архитектура является возможность наращивать мощность существующей системы за счет простого добавления новых узлов в систему. Причем увеличение мощности происходит практически пропорционально мощности добавленных ресурсов и может производиться без остановки системы во время ее функционирования. В системах с другой архитектурой (в частности MPP) обычно возможна только вертикальная масштабируемость: добавление памяти, увеличение числа процессоров в многопроцессорных системах или добавление новых адаптеров или дисков. Оно позволяет временно улучшить производительность системы. Однако в системе будет установлено максимальное поддерживаемое количество памяти, процессоров или дисков, системные ресурсы будут исчерпаны, и для увеличеия производительности придется создавать новую систему или существенно перерабатывать старую. Кластерная система также допускает вертикальную масштабируемость. Таким образом, за счет вертикального и горизонтального масштабирования кластерная модель обеспечивает большую гибкость и простоту увеличения производительности систем.

Проект Beowulf

Beowulf - это скандинавский эпос, повествующий о событиях VII - первой трети VIII века, участником которых является одноименный герой, прославивший себя в сражениях.

Одним из примеров реализации кластерной системы такой структуры являются кластеры Beowulf. Проект Beowulf объединил около полутора десятков организаций (главным образом университетов) в Соединенных Штатах. Ведущие разработчики проекта - специалисты агентства NASA. В данном виде кластеров можно выделить следующие основные особенности:

История проекта Beowulf

Проект начался летом 1994 года в научно-космическом центре NASA - Goddard Space Flight Center (GSFC), точнее в созданном на его основе CESDIS (Center of Excellence in Space Data and Information Sciences).

Первый Beowulf-кластер был создан на основе компьютеров Intel архитектуры под ОС Linux. Это была система, состоящая из 16 узлов (на процессорах 486DX4/100MHz, 16MB памяти и 3 сетевых адаптера на каждом узле, 3 "параллельных" Ethernet-кабеля по 10Mbit). Он создавался как вычислительный ресурс проекта "Earth and Space Sciences Project" (ESS).

Далее в GSFC и других подразделениях NASA были собраны другие, более мощные кластеры. Например, кластер theHIVE (Highly-parallel Integrated Virtual Environment) содержит 64 узла по 2 процессора Pentium Pro/200MHz и 4GB памяти в каждом, 5 коммутаторов Fast Ethernet. Общая стоимость этого кластера составляет примерно $210 тыс. В рамках проекта Beowulf был разработан ряд высокопроизводительных и специализированных сетевых драйверов (в частности, драйвер для использования нескольких Ethernet-каналов одновременно).

Архитектура Beowulf

Узлы кластера .

Это или однопроцессорные ПК, или SMP-сервера с небольшим числом процессоров (2-4, возможно до 6). По некоторым причинам оптимальным считается построение кластеров на базе двухпроцессорных систем, несмотря на то, что в этом случае настройка кластера будет несколько сложнее (главным образом потому, что доcтупны относительно недорогие материнские платы для 2 процессоров Pentium II/III). Стоит установить на каждый узел 64-128MB оперативной памяти (для двухпроцессорных систем 64-256MB).

Одну из машин следует выделить в качестве центральной (головной) куда следует установить достаточно большой жесткий диск, возможно более мощный процессор и больше памяти, чем на остальные (рабочие) узлы. Имеет смысл обеспечить (защищенную) связь этой машины с внешним миром.

При комплектации рабочих узлов вполне возможно отказаться от жестких дисков - эти узлы будут загружать ОС через сеть с центральной машины, что, кроме экономии средств, позволяет сконфигурировать ОС и все необходимое ПО только 1 раз (на центральной машине). Если эти узлы не будут одновременно использоваться в качестве пользовательских рабочих мест, нет необходимости устанавливать на них видеокарты и мониторы. Возможна установка узлов в стойки (rackmounting), что позволит уменьшить место, занимаемое узлами, но будет стоить несколько дороже.

Возможна организация кластеров на базе уже существующих сетей рабочих станций, т.е. рабочие станции пользователей могут использоваться в качестве узлов кластера ночью и в выходные дни. Системы такого типа иногда называют COW (Cluster of Workstations).

Количество узлов следует выбирать исходя из необходимых вычислительных ресурсов и доступных финансовых средств. Следует понимать, что при большом числе узлов придется также устанавливать более сложное и дорогое сетевое оборудование.

Сеть

Основные типы локальных сетей, задействованные в рамках проекта Beowulf, - это Gigabit Ethernet, Fast Ethernet и 100-VG AnyLAN. В простейшем случае используется один сегмент Ethernet (10Mbit/sec на витой паре). Однако дешевизна такой сети, вследствие коллизий оборачивается большими накладными расходами на межпроцессорные обмены; а хорошую производительность такого кластера следует ожидать только на задачах с очень простой параллельной структурой и при очень редких взаимодействиях между процессами (например, перебор вариантов).

Для получения хорошей производительности межпроцессорных обменов используют полнодуплексный Fast Ethernet на 100Mbit/sec. При этом для уменьшения числа коллизий или устанавливают несколько "параллельных" сегментов Ethernet, или соединяют узлы кластера через коммутатор (switch).

Более дорогостоящим, но также популярным вариантом являются использование коммутаторов типа Myrinet (1.28Gbit/sec, полный дуплекс).

Менее популярными, но также реально используемыми при построении кластеров сетевыми технологиями являются технологии сLAN, SCI и Gigabit Ethernet.

Иногда для связи между узлами кластера используют параллельно несколько физичеких каналов связи - так называемое «связывание каналов» (channel bonding), которое обычно применяется для технологии Fast Ethernet. При этом каждый узел подсоединяется к коммутатору Fast Ethernet более чем одним каналом. Чтобы достичь этого, узлы оснащаются либо несколькими сетевыми платами, либо многопортовыми платами Fast Ethernet. Применение связывания каналов в узлах под управлением ОС Linux позволяет организовать равномерное распределение нагрузки приема/передачи между соответствующими каналами.

Системное ПО

Операционная система . Обычно используется система Linux в версиях, специально оптимизированных под распределенные параллельные вычисления. Была проведена доработку ядра Linux 2.0. В процессе построения кластеров выяснилось, что стандартные драйверы сетевых устройств в Linux весьма неэффективны. Поэтому были разработаны новые драйверы, в первую очередь для сетей Fast Ethernet и Gigabit Ethernet, и обеспечена возможность логического объединения нескольких параллельных сетевых соединений между персональными компьютерами (аналогично аппаратному связыванию каналов) , что позволяет из дешевых локальных сетей, обладающих низкой пропускной способностью, соорудить сеть с высокой совокупной пропускной способностью.

Как и в любом кластере, на каждом узле кластера исполняется своя копия ядра ОС. Благодаря доработкам обеспечена уникальность идентификаторов процессов в рамках всего кластера, а не отдельных узлов.

Коммуникационные библиотеки . Наиболее распространенным интерфейсом параллельного программирования в модели передачи сообщений является MPI. Рекомендуемая бесплатная реализация MPI - пакет MPICH, разработанный в Аргоннской Национальной Лаборатории. Для кластеров на базе коммутатора Myrinet разработана система HPVM, куда также входит реализация MPI.

Для эффективной организации параллелизма внутри одной SMP-cистемы возможны два варианта:

  1. Для каждого процессора в SMP-машине порождается отдельный MPI-процесс. MPI-процессы внутри этой системы обмениваются сообщениями через разделяемую память (необходимо настроить MPICH соответствующим образом).
  2. На каждой машине запускается только один MPI-процесс. Внутри каждого MPI-процесса производится распараллеливание в модели "общей памяти", например с помощью директив OpenMP.

После установки реализации MPI имеет смысл протестировать реальную производительность сетевых пересылок.

Кроме MPI, есть и другие библиотеки и системы параллельного программирования, которые могут быть использованы на кластерах.

Пример реализации кластера Beowulf - Avalon

PRIVATEMichael Warren и другие ученые из группы теоретической астрофизики построили суперкомпьютер Avalon, который представляет из себя Beowulf -кластер на базе процессоров DEC Alpha/533MHz. Avalon первоначально состоял из 68 процессоров, затем был расширен до 140. В каждом узле установлено 256MB оперативной памяти, EIDE-жесткий диск на 3.2GB, сетевой адаптер от Kingston (общая стоимость узла - $1700). Узлы соединены с помощью 4-х 36-портовых коммутаторов Fast Ethernet и расположенного "в центре" 12-портового коммутатора Gigabit Ethernet от 3Com.

Общая стоимость Avalon - $313 тыс. , а его производительность по LINPACK (47.7 GFLOPS ) позволила ему занять 114 место в 12-й редакции списка Top500 (рядом с 152-процессорной системой IBM SP2). 70-процессорная конфигурация Avalon по многим тестам показала такую же производительность, как 64-процессорная система SGI Origin2000/195MHz стоимость которой превышает $1 млн.

В настоящее время Avalon активно используется в астрофизических, молекулярных и других научных вычислениях. На конференции SC"98 создатели Avalon представили доклад, озаглавленный "Avalon: An Alpha/Linux Cluster Achieves 10 Gflops for $150k" и заслужили премию по показателю цена/производительность ("1998 Gordon Bell Price/Performance Prize").

Заключение

Ведущие производители микропроцессоров: Sun Microsystems, Dell и IBM придерживаются одинаковой точки зрения на будущее отрасли суперкомпьютеров: на смену отдельным, независимым суперкомпьютерам должны прийти группы высокопроизводительных серверов, объединяемых в кластер. Уже сегодня распределенные кластерные системы опережают современные классические суперкомпьютеры по производительности: самый мощный на сегодняшний день компьютер в мире - IBM ASCI White - обладает производительностью в 12 ТераФЛОП, производительность сети SETI@Home оценивается примерно в 15 ТераФЛОП. При этом, IBM ASCI White был продан за 110 миллионов долларов, а за всю историю существования SETI@Home было потрачено около 500 тысяч долларов.

Проанализировав итоги работ, выполненных в рамках проекта Beowulf, можно прийти к следующему выводу: найденные решения позволяют самостоятельно собрать высокопроизводительный кластер на базе стандартных для ПК компонентов и использовать обычное программное обеспечение. Среди самых крупных экземпляров нельзя не отметить 50-узловой кластер в CESDIS, включающий 40 узлов обработки данных (на базе одно- и двухпроцессорных плат Рentium Рro/200 МГц) и 10 масштабирующих узлов (двухпроцессорная плата Рentium Рro/166 МГц). Соотношение стоимость/пиковая производительность в таком кластере представляется очень удачным. Вопрос в том, насколько эффективно удается распараллелить приложения - иными словами, какова будет реальная, а не пиковая производительность. Над решением этой проблемы сейчас и работают участники проекта.


Литература

3. http://newton.gsfc.nasa.gov/thehive/

4. http://www.lobos.nih.gov

5. http://parallel.ru/news/kentucky_klat2.html

6. http://parallel.ru/news/anl_chibacity.html

7. http://parallel.ru/cluster/

8. http://www.ptc.spbu.ru


Resources

MIMD компьютеры

MIMD компьютер имеет N процессоров, независимо исполняющих N потоков команд и обрабатывающих N потоков данных. Каждый процессор функционирует под управлением собственного потока команд, то есть MIMD компьютер может параллельно выполнять совершенно разные программы.

MIMD архитектуры далее классифицируются в зависимости от физической организации памяти, то есть имеет ли процессор свою собственную локальную память и обращается к другим блокам памяти, используя коммутирующую сеть, или коммутирующая сеть подсоединяет все процессоры к общедоступной памяти. Исходя из организации памяти, различают следующие типы параллельных архитектур:

  • Компьютеры с распределенной памятью (Distributed memory)
    Процессор может обращаться к локальной памяти, может посылать и получать сообщения, передаваемые по сети, соединяющей процессоры. Сообщения используются для осуществления связи между процессорами или, что эквивалентно, для чтения и записи удаленных блоков памяти. В идеализированной сети стоимость посылки сообщения между двумя узлами сети не зависит как от расположения обоих узлов, так и от трафика сети, но зависит от длины сообщения.
  • Компьютеры с общей (разделяемой) памятью (True shared memory)
    Все процессоры совместно обращаются к общей памяти, обычно, через шину или иерархию шин. В идеализированной PRAM (Parallel Random Access Machine - параллельная машина с произвольным доступом) модели, часто используемой в теоретических исследованиях параллельных алгоритмов, любой процессор может обращаться к любой ячейке памяти за одно и то же время. На практике масштабируемость этой архитектуры обычно приводит к некоторой форме иерархии памяти. Частота обращений к общей памяти может быть уменьшена за счет сохранения копий часто используемых данных в кэш-памяти, связанной с каждым процессором. Доступ к этому кэш-памяти намного быстрее, чем непосредственно доступ к общей памяти.
  • Компьютеры с виртуальной общей (разделяемой) памятью (Virtual shared memory)
    Общая память как таковая отсутствует. Каждый процессор имеет собственную локальную память и может обращаться к локальной памяти других процессоров, используя "глобальный адрес". Если "глобальный адрес" указывает не на локальную память, то доступ к памяти реализуется с помощью сообщений, пересылаемых по коммуникационной сети.

Примером машин с общей памятью могут служить:

  • Sun Microsystems (многопроцессорные рабочие станции)
  • Silicon Graphics Challenge (многопроцессорные рабочие станции)
  • Sequent Symmetry
  • Convex
  • Cray 6400.

Следующие компьютеры относятся к классу машин с распределенной памятью

  • IBM-SP1/SP2
  • Parsytec GC
  • CM5 (Thinking Machine Corporation)
  • Cray T3D
  • Paragon (Intel Corp.)
  • nCUBE
  • Meiko CS-2
  • AVX (Alex Parallel Computers)
  • IMS B008

MIMD архитектуры с распределенной памятью можно так же классифицировать по пропускной способности коммутирующей сети. Например, в архитектуре, в которой пары из процессора и модуля памяти (процессорный элемент) соединены сетью с топологий реш§тка, каждый процессор имеет одно и то же число подключений к сети вне зависимости от числа процессоров компьютера. Общая пропускная способность такой сети растет линейно относительно числа процессоров. С другой стороны в архитектуре, имеющей сеть с топологий гиперкуб, число соединений процессора с сетью является логарифмической функцией от числа процессоров, а пропускная способность сети растет быстрее, чем линейно по отношению к числу процессоров. В топологии клика каждый процессор должен быть соединен со всеми другими процессорами.

Сеть с топологией 2D реш§тка(тор)



Сеть с топологией 2D тор

Сеть с топологией клика

Национального Центра Суперкомпьютерных Приложений (университет шт. Иллинойс, Urbana-Champaign)

MPI: The Message Passing Interface

Название "интерфейс передачи сообщений", говорит само за себя. Это хорошо стандартизованный механизм для построения параллельных программ в модели обмена сообщениями. Существуют стандартные "привязки" MPI к языкам С/С++, Fortran 77/90. Существуют бесплатные и коммерческие реализации почти для всех суперкомпьютерных платформ, а также для сетей рабочих станций UNIX и Windows NT. В настоящее время MPI - наиболее широко используемый и динамично развивающийся интерфейс из своего класса.

Beowulf - кластеры на базе ОС Linux

Михаил Кузьминский

"Открытые системы"

На пороге тысячелетий мы имеем все шансы стать свидетелями монополизации компьютерной индустрии, которая может охватить как микропроцессоры, так и операционные системы. Конечно же, речь идет о микропроцессорах от Intel (Merced грозит вытеснить процессоры архитектуры RISC) и ОС от Microsoft.

В обоих случаях успех во многом определяется мощью маркетинговой машины, а не только "потребительскими" свойствами выпускаемых продуктов. По моему мнению, компьютерное сообщество еще не осознало масштабов возможных последствий.

Некоторые специалисты сопоставляют потенциальную монополизацию компьютерного рынка с наблюдавшимся в 70-е годы монопольным господством IBM - как в области мэйнфреймов, так и операционных систем. Я долгое время работаю с этой техникой и по мере распространения в нашей стране ОС Unix все больше осознаю многие преимущества операционной системы MVS производства IBM. Тем не менее я разделяю распространенную точку зрения, что подобная монополия не способствовала ускорению прогресса.

Западные университеты, которые в свое время одними из первых перешли к использованию Unix, по-прежнему в своих перспективных разработках опираются на эту систему, причем в качестве платформы все чаще избирается Linux. Одной из поучительных академических разработок и посвящена эта статья.

Linux как общественное явление

Мы уже не удивляемся тому, что Linux cтала заметным явлением компьютерной жизни. В сочетании с богатейшим набором свободно распространяемого программного обеспечения GNU эта операционная система стала чрезвычайно популярна у некоммерческих пользователей как у нас, так и за рубежом. Ее популярность все возрастает. Версии Linux существуют не только для платформы Intel x86, но и для других процессорных архитектур, в том числе DEC Alрha, и широко используются для приложений Internet, а также выполнения задач расчетного характера. Одним словом, Linux стала своеобразной "народной операционной системой". Hельзя, впрочем, сказать, что у Linux нет слабых мест; одно из них - недостаточная поддержка SMР-архитектур.

Самый дешевый способ нарастить компьютерные ресурсы, в том числе вычислительную мощность, - это построить кластер. Массивно-параллельные суперкомпьютеры с физически и логически распределенной оперативной памятью также можно рассматривать как своеобразные кластеры. Наиболее яркий пример такой архитектуры - знаменитый компьютер IBM SР2.

Весь вопрос в том, что связывает компьютеры (узлы) в кластер. В "настоящих" суперкомпьютерах для этого используется специализированная и поэтому дорогая аппаратура, призванная обеспечить высокую пропускную способность. В кластерах, как правило, применяются обычные сетевые стандарты - Ethernet, FDDI, ATM или HiРРI.

Кластерные технологии с использованием операционной системы Linux начали развиваться несколько лет назад и стали доступны задолго до появления Wolfрack для Windows NT. Так в середине 90-х годов и возник проект Beowulf.

Герой эпической поэмы

"Беовульф" - это скандинавский эпос, повествующий о событиях VII - первой трети VIII века, участником которых является одноименный герой, прославивший себя в сражениях. Неизвестно, задумывались ли авторы проекта, с кем ныне будет сражаться Beowulf (вероятно, с Windows NT?), однако героический образ позволил объединить в консорциум около полутора десятков организаций (главным образом университетов) в Соединенных Штатах. Нельзя сказать, что среди участников проекта доминируют суперкомпьютерные центры, однако кластеры "Локи" и "Мегалон" установлены в таких известных в мире высокопроизводительных вычислений центрах, как Лос-Аламос и лаборатория Sandia Министерства энергетики США; ведущие разработчики проекта - специалисты агентства NASA. Вообще, все без исключения кластеры, созданные участниками проекта, получают громкие имена.

Кроме Beowulf, известна еще одна близкая кластерная технология - NOW. В NOW персональные компьютеры обычно содержат информацию о самих себе и поставленных перед ними задачах, а в обязанности системного администратора такого кластера входит формирование данной информации. Кластеры Beowulf в этом отношении (то есть с точки зрения системного администратора) проще: там отдельные узлы не знают о конфигурации кластера. Лишь один выделенный узел содержит информацию о конфигурации; и только он имеет связь по сети с внешним миром. Все остальные узлы кластера объединены локальной сетью, и с внешним миром их связывает только "тоненький мостик" от управляющего узла.

Узлами в технологии Beowulf являются материнские платы ПК. Обычно в узлах задействованы также локальные жесткие диски. Для связи узлов используются стандартные типы локальных сетей. Этот вопрос мы рассмотрим ниже, сначала же остановимся на программном обеспечении.

Его основу в Beowulf составляет обычная коммерчески доступная ОС Linux, которую можно приобрести на CD-ROM. Первое время большинство участников проекта ориентировались на компакт-диски, издаваемые Slackware, а сейчас предпочтение отдаетcя версии RedHat.

В обычной ОС Linux можно инсталлировать известные средства распараллеливания в модели обмена сообщениями (LAM MРI 6.1, РVM 3.3.11 и другие). Можно также воспользоваться стандартом р-threads и стандартными средствами межпроцессорного взаимодействия, входящими в любую ОС Unix System V. В рамках проекта Beowulf были выполнены и серьезные дополнительные разработки.

Прежде всего следует отметить доработку ядра Linux 2.0. В процессе построения кластеров выяснилось, что стандартные драйверы сетевых устройств в Linux весьма неэффективны. Поэтому были разработаны новые драйверы (автор большинства разработок - Дональд Бекер), в первую очередь для сетей Fast Ethernet и Gigabit Ethernet, и обеспечена возможность логического объединения нескольких параллельных сетевых соединений между персональными компьютерами, что позволяет из дешевых локальных сетей, обладающих более чем скромной скоростью, соорудить сеть с высокой совокупной пропускной способностью.

Как и во всяком кластере, в каждом узле живет своя копия ядра ОС. Благодаря доработкам обеспечена уникальность идентификаторов процессов в рамках всего кластера, а не отдельных узлов, а также "удаленная доставка" сигналов ОС Linux.

Кроме того, надо отметить функции загрузки по сети (netbooting) при работе с материнскими платами Intel РR 440FX, причем они могут применяться и для работы с другими материнскими платами, снабженными AMI BIOS.

Очень интересные возможности предоставляют механизмы сетевой виртуальной памяти (Network Virtual Memory) или разделяемой распределенной памяти DSM (Distributed Shared Memory), позволяющие создать для процесса определенную "иллюзию" общей оперативной памяти узлов.

Сеть - дело тонкое

Поскольку для распараллеливания суперкомпьютерных приложений вообще, и кластерных в частности, необходима высокая пропускная способность и низкие задержки для обмена сообщениями между узлами, сетевые характеристики становятся параметрами, определяющими производительность кластера. Выбор микропроцессоров для узлов очевиден - это стандартные процессоры производства Intel; а вот с топологией кластера, типом сети и сетевых плат можно поэкспериментировать. Именно в этой области и проводились основные исследования.

При анализе различных сетевых плат ПК, представленных сегодня на рынке, особое внимание было уделено таким характеристикам, как эффективная поддержка широковещательной рассылки (multicasting), поддержка работы с пакетами больших размеров и т. д. Основные типы локальных сетей, задействованные в рамках проекта Beowulf, - это Gigabit Ethernet, Fast Ethernet и 100-VG AnyLAN. (Возможности ATM-технологии также активно исследовались, но, насколько известно автору, это делалось вне рамок данного проекта.)

Как самому собрать суперкомпьютер

Проанализировав итоги работ, выполненных в рамках проекта Beowulf, можно прийти к следующему выводу: найденные решения позволяют самостоятельно собрать высокопроизводительный кластер на базе стандартных для ПК компонентов и использовать обычное программное обеспечение. Среди самых крупных экземпляров нельзя не отметить 50-узловой кластер в CESDIS, включающий 40 узлов обработки данных (на базе одно- и двухпроцессорных плат Рentium Рro/200 МГц) и 10 масштабирующих узлов (двухпроцессорная плата Рentium Рro/166 МГц). Соотношение стоимость/пиковая производительность в таком кластере представляется очень удачным. Вопрос в том, насколько эффективно удается распараллелить приложения - иными словами, какова будет реальная, а не пиковая производительность. Над решением этой проблемы сейчас и работают участники проекта.

Следует отметить, что построение кластеров из обычных ПК становится сегодня достаточно модным в научной среде. Некоторые академические институты в нашей стране также планируют создать подобные кластеры.

При объединении в кластер компьютеров разной мощности или разной архитектуры, говорят о гетерогенных (неоднородных) кластерах. Узлы кластера могут одновременно использоваться в качестве пользовательских рабочих станций. В случае, когда это не нужно, узлы могут быть существенно облегчены и/или установлены в стойку.

Используются стандартные для рабочих станций ОС, чаще всего, свободно распространяемые - Linux/FreeBSD, вместе со специальными средствами поддержки параллельного программирования и распределения нагрузки. Программирование, как правило, в рамках модели передачи сообщений (чаще всего - MPI). Более подробно она рассмотрена в следующем параграфе.

История развития кластерной архитектуры.

Компания DEC первой анонсировала концепцию кластерной системы в 1983 году, определив ее как группу объединенных между собой вычислительных машин, представляющих собой единый узел обработки информации.

Один из первых проектов, давший имя целому классу параллельных систем – кластеры Beowulf – возник в центре NASA Goddard Space Flight Center для поддержки необходимыми вычислительными ресурсами проекта Earth and Space Sciences. Проект Beowulf стартовал летом 1994 года, и вскоре был собран 16-процессорный кластер на процессорах Intel 486DX4/100 МГц. На каждом узле было установлено по 16 Мбайт оперативной памяти и по 3 сетевых Ethernet-адаптера. Для работы в такой конфигурации были разработаны специальные драйверы, распределяющие трафик между доступными сетевыми картами.

Позже в GSFC был собран кластер theHIVE – Highly-parallel Integrated Virtual Environment , структура которого показана на рис. 2. Этот кластер состоит из четырех подкластеров E, B, G, и DL, объединяя 332 процессора и два выделенных хост-узла. Все узлы данного кластера работают под управлением RedHat Linux.

В 1998 году в Лос-Аламосской национальной лаборатории астрофизик Майкл Уоррен и другие ученые из группы теоретической астрофизики построили суперкомпьютер Avalon, который представляет собой Linux-кластер на базе процессоров Alpha 21164A с тактовой частотой 533 МГц. Первоначально Avalon состоял из 68 процессоров, затем был расширен до 140. В каждом узле установлено по 256 Мбайт оперативной памяти, жесткий диск на 3 Гбайт и сетевой адаптер Fast Ethernet. Общая стоимость проекта Avalon составила 313 тыс. долл., а показанная им производительность на тесте LINPACK – 47,7 GFLOPS, позволила ему занять 114 место в 12-й редакции списка Top500 рядом с 152-процессорной системой IBM RS/6000 SP. В том же 1998 году на самой престижной конференции в области высокопроизводительных вычислений Supercomputing’98 создатели Avalon представили доклад «Avalon: An Alpha/Linux Cluster Achieves 10 Gflops for $150k», получивший первую премию в номинации «наилучшее отношение цена/производительность».

В апреле текущего года в рамках проекта AC3 в Корнелльском Университете для биомедицинских исследований был установлен кластер Velocity+, состоящий из 64 узлов с двумя процессорами Pentium III/733 МГц и 2 Гбайт оперативной памяти каждый и с общей дисковой памятью 27 Гбайт. Узлы работают под управлением Windows 2000 и объединены сетью cLAN компании Giganet.

Проект Lots of Boxes on Shelfes реализован в Национальном Институте здоровья США в апреле 1997 года и интересен использованием в качестве коммуникационной среды технологии Gigabit Ethernet. Сначала кластер состоял из 47 узлов с двумя процессорами Pentium Pro/200 МГц, 128 Мбайт оперативной памяти и диском на 1,2 Гбайт на каждом узле. В 1998 году был реализован

следующий этап проекта – LoBoS2, в ходе которого узлы были преобразованы в настольные компьютеры с сохранением объединения в кластер. Сейчас LoBoS2 состоит из 100 вычислительных узлов, содержащих по два процессора Pentium II/450 МГц, 256 Мбайт оперативной и 9 Гбайт дисковой памяти. Дополнительно к кластеру подключены 4 управляющих компьютера с общим RAID-массивом емкостью 1,2 Тбайт.

Одной из последних кластерных разработок стал суперкомпьютер AMD Presto III, представляющий собой кластер Beowulf из 78 процессоров Athlon. Компьютер установлен в Токийском Технологическом Институте. На сегодняшний день AMD построила 8 суперкомпьютеров, объединенных в кластеры по методу Beowulf, работающих под управлением ОС Linux.

Кластеры IBM

Компания IBM предлагает несколько типов слабо связанных систем на базе RS/6000, объединенных в кластеры и работающих под управлением программного продукта High-Availability Clastered Multiprocessor/6000 (HACMP/6000).

Узлы кластера работают параллельно, разделяя доступ к логическим и физическим ресурсам пользуясь возможностями менеджера блокировок, входящего в состав HACMP/6000.

Начиная с объявления в 1991 году продукт HACMP/6000 постоянно развивался. В его состав были включены параллельный менеджер ресурсов, распределенный менеджер блокировок и параллельный менеджер логических томов, причем последний обеспечил возможность балансировки загрузки на уровне всего кластера. Максимальное количество узлов в кластере возросло до восьми. В настоящее время в составе кластера появились узлы с симметричной многопроцессорной обработкой, построенные по технологии Data Crossbar Switch, обеспечивающей линейный рост производительности с увеличением числа процессоров.

Кластеры RS/6000 строятся на базе локальных сетей Ethernet, Token Ring или FDDI и могут быть сконфигурированы различными способами с точки зрения обеспечения повышенной надежности:

  • Горячий резерв или простое переключение в случае отказа. В этом режиме активный узел выполняет прикладные задачи, а резервный может выполнять некритичные задачи, которые могут быть остановлены в случае необходимости переключения при отказе активного узла.
  • Симметричный резерв. Аналогичен горячему резерву, но роли главного и резервного узлов не фиксированы.
  • Взаимный подхват или режим с распределением нагрузки. В этом режиме каждый узел в кластере может "подхватывать" задачи, которые выполняются на любом другом узле кластера.

IBM SP2 лидируют в списке крупнейших суперкомпьютеров TOP500 по числу инсталляций (141 установка, а всего в мире работает 8275 таких компьютеров с общим числом узлов свыше 86 тыс. В основу этих суперкомпьютеров заложенный в основу архитектуры кластерный подход с использованием мощного центрального коммутатора. IBM использует этот подход уже много лет.

Общая архитектура SP2

Общее представление об архитектуре SP2 дает рис. 1. Основная ее особенность архитектуры - применение высокоскоростного коммутатора с низкими задержками для соединения узлов между собой. Эта внешне предельно простая схема, как показал опыт, оказалась чрезвычайно гибкой. Сначала узлы SP2 были однопроцессорными, затем появились узлы с SMP-архитектурой.

Собственно, все детали скрываются в строении узлов. Мало того, узлы бывают различных типов, причем даже процессоры в соседних узлах могут быть разными. Это обеспечивает

большую гибкость выбора конфигураций. Общее число узлов в вычислительной системе может достигать 512. Узлы SP2 фактически являются самостоятельными компьютерами, и их прямые аналоги продаются корпорацией IBM под самостоятельными названиями. Наиболее ярким примером этого является четырехпроцессорный SMP-сервер RS/6000 44P-270 c микропроцессорами Power3-II, который сам по себе можно отнести к классу компьютеров среднего класса или даже к мини-суперкомпьютерам.

Устанавливавшиеся в узлах SP2 микропроцессоры развивались по двум архитектурным линиям: Power - Power2 - Power3 - Power3-II и по линии PowerPC вплоть до модели 604e с тактовой частотой 332 МГц.

Традиционными для SP2 являются «тонкие» (Thin Node) и «широкие» (Wide Node) узлы, обладающие SMP-архитектурой. В них могут устанавливаться как PowerPC 604e (от двух до четырех процессоров), так и Power3-II (до четырех). Емкость оперативной памяти узлов составляет от 256 Мбайт до 3 Гбайт (при использовании Power3-II - до 8 Гбайт). Основные отличия между тонкими и широкими узлами касаются подсистемы ввода/вывода. Широкие узлы предназначены для задач, требующих более мощных возможностей ввода/вывода: в них имеется по десять слотов PCI (в том числе три 64-разрядных) против двух слотов в тонких узлах. Соответственно, и число монтажных отсеков для дисковых устройств в широких узлах больше.

Быстродействие коммутатора характеризуется низкими величинами задержек: 1,2 мс (до 2 мс при числе узлов свыше 80). Это на порядок лучше того, что можно получить в современных Linux-кластерах Beowulf. Пиковая пропускная способность каждого порта: она составляет 150 Мбайт/с в одном направлении (то есть 300 Мбайт/с при дуплексной передаче). Той же пропускной способностью обладают и расположенные в узлах SP2 адаптеры коммутатора. IBM приводит также отличные результаты по задержкам и пропускной способности.

Наиболее мощные узлы SP2 - «высокие» (High Node). Высокий узел - это комплекс, состоящий из вычислительного узла с подсоединенными устройствами расширения ввода/вывода в количестве до шести штук. Такой узел также обладает SMP-архитектурой и содержит до 8 процессоров Power3 с тактовой частотой 222 или 375 МГц.

Кроме того, узел этого типа содержит плату ввода/вывода, которая также подсоединена к системной плате. Плата ввода/вывода содержит два симметричных логических блока SABER, через которые осуществляется передача данных к внешним устройствам, таким

как диски и телекоммуникационное оборудование. На плате ввода/вывода имеется четыре слота 64-разрядной шины PCI и один 32-разрядный слот (частота 33 МГц), а также интегрированы контроллеры UltraSCSI, Ethernet 10/100 Мбит/с, три последовательных и один параллельный порт.

C появлением высоких узлов и микропроцессоров Power3-II/375 МГц на тестах Linpack parallel системы IBM SP2 достигли производительности 723,4 GFLOPS. Этот результат достигнут при использовании 176 узлов (704 процессора). Учитывая, что узлов можно установить до 512, этот результат показывает, что серийно выпускаемые IBM SP2 потенциально близки к отметке 1 TFLOPS.

Кластерные решения Sun Microsystems

Sun Microsystems предлагает кластерные решения на основе своего продукта SPARCclaster PDB Server, в котором в качестве узлов используются многопроцессорные SMP-серверы SPARCserver 1000 и SPARCcenter 2000. Максимально в состав SPARCserver 1000 могут входить до восьми процессоров, а в SPARCcenter 2000 до 20 процессоров SuperSPARC. В комплект базовой поставки входят следующие компоненты: два кластерных узла на основе SPARCserver 1000/1000E или SPARCcenter 2000/2000E, два дисковых массива SPARCstorage Array, а также пакет средств для построения кластера, включающий дублированное оборудование для осуществления связи, консоль управления кластером Claster Management Console, программное обеспечение SPARCclaster PDB Software и пакет сервисной поддержки кластера.

Для обеспечения высокой производительности и готовности коммуникаций кластер поддерживает полное дублирование всех магистралей данных. Узлы кластера объединяются с помощью каналов SunFastEthernet с пропускной способностью 100 Мбит/с. Для подключения дисковых подсистем используется оптоволоконный интерфейс Fibre Channel с пропускной способностью 25 Мбит/с, допускающий удаление накопителей и узлов друг от друга на расстояние до 2 км. Все связи между узлами, узлами и дисковыми подсистемами дублированы на аппаратном уровне. Аппаратные, программные и сетевые средства кластера обеспечивают отсутствие такого места в системе, одиночный отказ или сбой которого выводил бы всю систему из строя.

Университетские проекты

Интересная разработка Университета штата Кентукки – кластер KLAT2 (Kentucky Linux Athlon Testbed 2 ). Система KLAT2 состоит из 64 бездисковых узлов с процессорами AMD Athlon/700 МГц и оперативной памятью 128 Мбайт на каждом. Программное обеспечение, компиляторы и математические библиотеки (SCALAPACK, BLACS и ATLAS) были доработаны для эффективного использования технологии 3DNow! процессоров AMD, что позволило увеличить производительность. Значительный интерес представляет и использованное сетевое решение, названное «Flat Neighbourghood Network» (FNN). В каждом узле установлено четыре сетевых адаптера Fast Ethernet от Smartlink, а узлы соединяются с помощью девяти 32-портовых коммутаторов. При этом для любых двух узлов всегда есть прямое соединение через один из коммутаторов, но нет необходимости в соединении всех узлов через единый коммутатор. Благодаря оптимизации программного обеспечения под архитектуру AMD и топологии FNN удалось добиться рекордного соотношения цена/производительность – 650 долл. за 1 GFLOPS.

Идея разбиения кластера на разделы получила интересное воплощение в проекте Chiba City , реализованном в Аргоннской Национальной лаборатории. Главный раздел содержит 256 вычислительных узлов, на каждом

из которых установлено два процессора Pentium III/500 МГц, 512 Мбайт оперативной памяти и локальный диск емкостью 9 Гбайт. Кроме вычислительного раздела в систему входят раздел визуализации (32 персональных компьютера IBM Intellistation с графическими платами Matrox Millenium G400, 512 Мбайт оперативной памяти и дисками 300 Гбайт), раздел хранения данных (8 серверов IBM Netfinity 7000 с процессорами Xeon/500 МГц и дисками по 300 Гбайт) и управляющий раздел (12 компьютеров IBM Netfinity 500). Все они объединены сетью Myrinet, которая используется для поддержки параллельных приложений, а также сетями Gigabit Ethernet и Fast Ethernet для управляющих и служебных целей. Все разделы делятся на «города» (town) по 32 компьютера. Каждый из них имеет своего «мэра», который локально обслуживает свой «город», снижая нагрузку на служебную сеть и обеспечивая быстрый доступ к локальным ресурсам.

Кластерные проекты в России

В России всегда была высока потребность в высокопроизводительных вычислительных ресурсах, и относительно низкая стоимость кластерных проектов послужила серьезным толчком к широкому распространению подобных решений в нашей стране. Одним из первых появился кластер «Паритет», собранный в ИВВиБД и состоящий из восьми процессоров Pentium II, связанных сетью Myrinet. В 1999 году вариант кластерного решения на основе сети SCI был апробирован в НИЦЭВТ, который, по сути дела, и был пионером использования технологии SCI для построения параллельных систем в России.

Высокопроизводительный кластер на базе коммуникационной сети SCI, установлен в Научно-исследовательском вычислительном центре Московского государственного университета . Кластер НИВЦ включает 12 двухпроцессорных серверов «Эксимер» на базе Intel Pentium III/500 МГц, в общей сложности 24 процессора с суммарной пиковой производительностью 12 млрд. операций в секунду. Общая стоимость системы – около 40 тыс. долл. или примерно 3,33 тыс. за 1 GFLOPS.

Вычислительные узлы кластера соединены однонаправленными каналами сети SCI в двумерный тор 3x4 и одновременно подключены к центральному серверу через вспомогательную сеть Fast Ethernet и коммутатор 3Com Superstack. Сеть SCI – это ядро кластера, делающее данную систему уникальной вычислительной установкой суперкомпьютерного класса, ориентированной на широкий класс задач. Максимальная скорость обмена данными по сети SCI в приложениях пользователя составляет более 80 Мбайт/с, а время латентности около 5,6 мкс. При построении данного вычислительного кластера использовалось интегрированное решение Wulfkit, разработанное компаниями Dolphin Interconnect Solutions и Scali Computer (Норвегия).

Основным средством параллельного программирования на кластере является MPI (Message Passing Interface) версии ScaMPI 1.9.1. На тесте LINPACK при решении системы линейных уравнений с матрицей размера 16000х16000 реально полученная производительность составила более 5,7 GFLOPS. На тестах пакета NPB производительность кластера сравнима, а иногда и превосходит производительность суперкомпьютеров семейства Cray T3E с тем же самым числом процессоров.

Основная область применения вычислительного кластера НИВЦ МГУ – это поддержка фундаментальных научных исследований и учебного процесса.

Из других интересных проектов следует отметить решение, реализованное в Санкт-Петербургском университете на базе технологии Fast Ethernet : собранные кластеры могут использоваться и как полноценные независимые учебные классы, и как единая вычислительная установка, решающая единую задачу. В Самарском научном центре

пошли по пути создания неоднородного вычислительного кластера, в составе которого работают компьютеры на базе процессоров Alpha и Pentium III. В Санкт-Петербургском техническом университете собирается установка на основе процессоров Alpha и сети Myrinet без использования локальных дисков на вычислительных узлах. В Уфимском государственном авиационном техническом университете проектируется кластер на базе двенадцати Alpha-станций, сети Fast Ethernet и ОС Linux.

Московский Государственный Инженерно-Физический Институт (Технический Университет) кафедра 29 "Управляющие Интеллектуальные Системы" Реферат на тему: Кластерные системы

Кластерные вычисления не являются новой областью. Однако в последнее время интерес к ним значительно возрос - многие организации рассматривают кластеры как основной инструмент для решения таких проблем, как повышение производительности приложений, обеспечение высокой доступности, а также высокой масштабируемости своих вычислительных систем.

Успехи, достигнутые в кластерных технологиях в последнее десятилетие, позволили использовать для их построения недорогие компьютеры. Экономичность, вычислительная мощность и гибкость таких кластеров сделали их привлекательной альтернативой централизованной модели вычислений на базе традиционных суперкомпьютеров (в дальнейшем под словом «кластер» мы будем понимать массовый продукт, в отличие от «спецзаказа»).

Кластеры появились как недорогая и эффективная альтернатива монокорпусным суперкомпьютерам с оригинальной закрытой архитектурой. Построенные на базе серийно выпускаемых компонентов, они широко применяются для выполнения высокопроизводительных вычислений, обеспечения доступности и масштабируемости. И если первая возможность интересует в основном академические круги, то две последние весьма привлекательны для бизнеса любого масштаба. И не только привлекательны, но и доступны.

Сегодня недорогой кластер из компонентов, находящихся в массовом производстве, может собрать практически любая уважающая себя компьютерная фирма, а с выходом такой кластерной ОС, как Windows Computing Cluster Server 2003, допускающей довольно простую инсталляцию, кластерные решения начального уровня становятся доступными малому и среднему бизнесу. И, пожалуй, не покажется необоснованным предположение, что перманентное снижение цен на аппаратные и программные компоненты и скоростные сетевые технологии вскоре сделают кластеры начального уровня привычным элементом ИС любого масштаба.

Поэтому в Тему недели, посвященную кластерным вычислениям, мы постарались включить не только обзорную часть, но и статьи о конкретных и, несомненно, востребованных в ближайшем будущем украинским бизнесом продуктах. В частности, читатель найдет здесь и практическое занятие, выполненное в нашей Тестовой лаборатории, и описание кластерных ОС Windows Computing Cluster Server 2003/2008, которые имеют все шансы стать популярными.

Прежде всего напомним определение кластера. Так называется локальная (в противоположность распределенной) вычислительная система, состоящая из множества независимых компьютеров, связанных между собой каналами передачи данных. Локальность кластера заключается в том, что все его подсистемы «видны» в едином административном домене, и управление им выполняется как единой вычислительной системой. Компьютеры, входящие в состав кластера, именуются узлами (node). Обычно это серийно выпускаемые универсальные компьютеры, способные работать самостоятельно. Узлы могут быть одно- или мультипроцессорными (конфигурация SMP). В классической схеме все узлы при работе с приложениями разделяют внешнюю память на массиве жестких дисков, используя внутренние HDD для более специальных функций. Для межузлового взаимодействия обычно применяется какая-либо стандартная сетевая технология, хотя это не исключает отдельно разработанных каналов связи. Кластерная сеть является обособленной - она изолирована от внешней сетевой среды.

Классификация

Кластеры можно классифицировать по разным признакам, однако чаще всего их разбивают на три категории, которые определяются характером и назначением приложения.

Кластеры высокой готовности (High Availability, HA) . Иногда их еще называют отказоустойчивыми. Такие кластеры проектируются для обеспечения конечным пользователям бесперебойного доступа к данным или сервисам (в типичном случае - веб-сервисам). Как правило, один экземпляр приложения работает на одном узле, а когда тот становится недоступным, то управление им перехватывается другим узлом (рис. 1). Подобная архитектура позволяет также проводить ремонт и профилактические работы, не останавливая сервисы. Вдобавок, если один узел выходит из строя, сервис может быть восстановлен без ущерба для доступности остальных. Правда, производительность системы понизится.

Кластеры высокой готовности являются наилучшим выбором для обеспечения работы критически важных приложений или баз данных, почты, файл-, принт- и веб-серверов, а также серверов приложений. В отличие от распределенных и параллельных вычислений, эти кластеры легко и прозрачно включают имеющиеся у организаций приложения, не ориентированные на кластеры, что позволяет без проблем расширять сеть по мере роста бизнеса.

Кластеры балансировки нагрузки (Load Balancing) . Этот тип кластеров распределяет входящие запросы между множеством узлов, на которых работают одинаковые программы или размещен один и тот же контент (рис. 2). Каждый узел способен обрабатывать запросы к одному и тому же приложению или контенту. Если какой-нибудь из узлов выходит из строя, запросы перераспределяются среди оставшихся. В типичном случае такие кластеры используются для веб-хостинга.

Обе рассмотренные выше кластерные технологии могут быть объединены для увеличения надежности, доступности и масштабируемости приложений.

Кластеры для высокопроизводительных вычислений (High-Performance Cluster, HPC) . Традиционно параллельные вычисления выполнялись на мультипроцессорных системах, специально для этого спроектированных. В них множество процессоров разделяли общую память и шинный интерфейс в пределах одного компьютера. С появлением высокоскоростной коммутационной технологии стало возможным объединять компьютеры в кластеры для параллельных вычислений.

Параллельный кластер - это система, использующая множество узлов для распараллеливания вычислений при решении специфической задачи. В отличие от кластеров балансировки нагрузки и высокой готовности, которые распределяют запросы/задачи между узлами, обрабатывающими их в целом, в параллельной среде запрос подразделяется на множество подзадач, а те, в свою очередь, распределяются для обработки между узлами внутри кластера. Применяются параллельные кластеры главным образом для приложений, требующих интенсивных математических вычислений.

Компоненты кластера

Базовые строительные блоки (компоненты) кластеров разбиваются на несколько категорий: непосредственно узлы, кластерное ПО, выделенная сеть, производящая обмен данными между узлами, и соответствующие сетевые протоколы.

Узлы

Конструктивно узлы мигрировали от традиционных пьедестальных корпусов к монтируемым в одну стойку мультипроцессорным системам и лезвийным серверам, которые обеспечивают более высокую процессорную плотность в условиях дефицита пространства.

В последнее время производительность процессоров, памяти, скорость доступа к жестким дискам и их емкость значительно увеличились. Интересно отметить, что при таком, в некоторых случаях экспоненциальном, росте быстродействия стоимость этих технологий существенно снизилась.

В типичном случае узел в кластере может быть управляющим (главным) или вычислительным (подчиненным) (рис. 3). Главный узел может быть только один. Он отвечает за работу кластера, а также является ключевым для кластерного ПО промежуточного слоя, процессов маршрутизации, диспетчеризации и мониторинга состояния каждого вычислительного узла. Последние выполняют вычисления и операции с системой хранения данных. Эти узлы, по сути, представляют собой полнофункциональные автономные компьютеры и, как правило, продаются как десктопы или серверы «из коробки».

Программное обеспечение

Как и в обычном настольном компьютере, ОС кластера является сердцем каждого его узла. Она незримо присутствует при любом действии пользователя, будь то обращение к файловой системе, отправка сообщений или старт дополнительного процесса. Пользователи могут выбирать различные парадигмы программирования или ПО промежуточного слоя, но кластерная ОС для всех одна и та же.

Типичный эскиз проекта ОС приведен в таблице. На нем показаны базовые блоки традиционного узла. Основная роль кластерной ОС заключается в первую очередь в том, чтобы мультиплексировать множество пользовательских процессов на единый набор аппаратных компонентов (управление ресурсами) и обеспечить пригодные абстракции для высокоуровневого ПО. Некоторые из этих абстракций включают защиту границ памяти, координацию процессов/потоков и коммуникаций и управление устройствами. Нужно отметить, что большинство специфических для кластера функций выполняется ПО промежуточного слоя. И для этого есть основания. Действительно, ОС кластера достаточно сложна, и не всегда ясно, как произведенные изменения повлияют на остальные системы. Поэтому необходимые модификации лучше проводить на уровне ПО промежуточного слоя, причем добавленная в него новая функциональность может быть портирована на другие ОС.

В приведенном определении кластера было упомянуто, что он виден администратору и пользователю как единая вычислительная система. Это достигается с помощью образа единой системы (Single System Image, SSI) . Именно он скрывает неоднородную и распределенную природу имеющихся ресурсов и представляет их пользователям и приложениям как единый вычислительный ресурс. SSI может быть реализован на одном или нескольких из следующих уровней: аппаратном, ОС, ПО промежуточного слоя или/и приложения. Вот пример нескольких ключевых сервисов, предоставляемых SSI кластера:

  • единая точка входа;
  • единый пользовательский интерфейс;
  • единое пространство процессов;
  • единое пространство памяти и ввода-вывода;
  • единая иерархия файлов;
  • единая точка контроля и управления.

Такие системы, как Digital/Compaq Memory Channel и Distributed Shared Memory обеспечивают SSI на аппаратном уровне и позволяют пользователям видеть кластер как систему с разделяемой памятью. ОС SCO UnixWare NonStop Cluster, Sun Solaris-MC, GLUNIX и MOSIX поддерживают SSI на уровне ядра.

Реализация SSI на каждом из вышеперечисленных уровней имеет свои pro и contra. Так, аппаратный уровень может предоставить наивысшую степень прозрачности, но из-за жесткой архитектуры он не менее гибок, чем требуется для расширений и улучшений системы. Уровень ядра предоставляет SSI как разработчикам, так и конечным пользователям, однако он слишком дорог и его трудно модифицировать. Основное преимущество уровня приложений по сравнению с уровнем ядра заключается в том, что на первом SSI реализуется поэтапно, и пользователь получает предоставляемые возможности немедленно, тогда как при втором подходе продукт не может выйти на рынок, пока все компоненты ядра не будут поддерживать SSI. Уровень ПО промежуточного слоя является компромиссным между двумя вышеупомянутыми механизмами реализации SSI.

Сетевое оборудование и протоколы

Создание общедоступных кластеров стало возможным только благодаря адекватным сетевым технологиям для межузловых коммуникаций. Общедоступные кластеры включают одну или более выделенных сетей для передачи пакетов сообщений внутри распределенной системы. Это отличает кластер от ансамбля слабосвязанных посредством разделяемой ЛВС автономных компьютеров.

Сегодня у разработчиков кластеров имеются широкие возможности для выбора сетевой технологии. Поскольку стоимость сетевого оборудования для кластеров варьируется от «почти даром» до нескольких тысяч долларов на один узел, то таковой может быть не последней составляющей в формировании цены продукта. Практика дает примеры построения весьма эффективных кластеров с использованием недорогого сетевого оборудования, которое можно увидеть в обычной ЛВС. В то же время отдельные сетевые продукты, специально разработанные для кластерных коммуникаций, сравнимы по стоимости с рабочими станциями. Выбор сетевой технологии зависит от ряда факторов: цены, производительности, совместимости с другим кластерным оборудованием и ПО, а также от коммуникационных характеристик приложений, которые будут выполняться на кластере.

Производительность сети в общем описывается в терминах латентности и полосы пропускания. Латентностью называется отрезок времени от запроса данных до их получения, или время, за которое они передаются от одного компьютера другому, включая непродуктивные затраты ПО на формирование сообщения и время передачи битов. В идеале в приложениях, написанных для кластеров, обмен сообщениями должен быть минимальным. Если приложение посылает большое количество коротких сообщений, тогда его производительность будет зависеть от латентности сети, если же происходит обмен длинными сообщениями, то основное влияние на этот параметр окажет ее пропускная способность. Очевидно, производительность приложения будет наилучшей при низкой латентности и широкой полосе пропускания. Для удовлетворения этих двух требований необходимы эффективные коммуникационные протоколы, минимизирующие объем служебных данных, и быстрые сетевые устройства.

Коммуникационные, или сетевые, протоколы определяют правила и соглашения, которые будут использовать два или более компьютеров в сети для обмена информацией. Они могут быть с установкой или без установки соединения, предоставлять разный уровень надежности - с полной гарантией доставки в порядке следования пакетов и без таковой, синхронные (без буферизации) и асинхронные (с буферизацией).

Для кластерных коммуникаций применяются как традиционные сетевые протоколы, разработанные первоначально для Интернета (IP), так и созданные специально. Помимо этого, имеются два относительно новых стандарта, также специально предназначенных для кластеров. Мы не будем останавливаться на достаточно знакомом нашим читателям протоколе IP, равно как и на остальных, поскольку все они довольно специфичны. Перечислим лишь их названия, чтобы интересующиеся могли обратиться либо к литературе, либо к «всезнающему» Интернету. Это, в частности, протоколы Active Messages, Fast Messages, Virtual Memory-Mapped Communication system, U-net и Basic Interface for Parallelism. Обратимся к двум стандартам.

К 1997 г. исследования в области протоколов с низкой латентностью продвинулись настолько, что в итоге привели к созданию нового стандарта для кластерных коммуникаций Virtual Interface Architecture (VIA). Одновременно индустрия работала над стандартами для разделяемых подсистем хранения. Результатом этих усилий явился InfiniBand.

VIA - это коммуникационный стандарт, объединяющий лучшие достижения различных проектов. Он был создан консорциумом академических и индустриальных партнеров, включающим Intel, Compaq и Microsoft. Версия VIA 1.1 с поддержкой гетерогенных аппаратных средств стала доступной в начале 2001 г. Как следует из названия, базируется VIA на концепции виртуального сетевого интерфейса. Стандарт предусматривает, что перед отправкой сообщения приемный и посылающий буфера должны быть выделены и привязаны к физической памяти. После того как буфера и связанные с ними структуры данных сформированы, никаких системных вызовов не требуется. Операции приема и отправки в пользовательском приложении состоят из записи дескриптора в очередь. Приложение может выбирать, ждать ли ему подтверждения завершения операции или продолжать основную работу, пока сообщение обрабатывается.

Хотя VIA может быть доступен прямо для прикладного программирования, многие разработчики систем считают, что это слишком низкий уровень для приложений, так как последние должны быть ответственными за распределение части физической памяти и следить за ее эффективным использованием. Предполагается, что большинство производителей ОС и ПО промежуточного слоя обеспечат интерфейс с VIA, который будет поддерживать прикладное программирование. Так, осенью 2000 г. большинство поставщиков баз данных предоставили версии своих продуктов, работающих поверх VIA. Быстро становится доступным и другое кластерное ПО, например файловые системы.

Стандарт InfiniBand был поддержан консорциумом индустриальных партнеров, в том числе Compaq, Dell, HP, IBM, Intel, Microsoft и Sun Microsystems. Архитектура InfiniBand заменяет разделяемую шину, которая является стандартом для системы ввода-вывода в современных компьютерах, высокоскоростной последовательной, базированной на механизме каналов коммутационной фабрикой. Все системы и устройства подключаются к фабрике посредством канального адаптера хоста (Host Channel Adaptor, HCA), который обеспечивает соединение центрального процессора хоста со структурой InfiniBand, или канального адаптера целевого узла (Target Channel Adaptor, TCA), соединяющего InfiniBand с другими устройствами ввода-вывода типа Ethernet, Fibre Channel или с системами хранения данных. Канал InfiniBand дуплексный и работает с пропускной способностью 2,5 Гб/с в одном направлении в топологии «точка-точка». Данные посылаются пакетами, имеется шесть режимов передачи: надежное и ненадежное соединение, надежная и ненадежная дейтаграмма, многоадресная рассылка и необработанные пакеты («сырой» режим). Вдобавок InfiniBand поддерживает удаленный прямой доступ к памяти, который позволяет одному процессору читать или писать в память другого.

Что касается сетевого оборудования, поддерживающего межузловой обмен, то оно может быть классифицировано с помощью четырех категорий - в зависимости от того, выполняется ли подсоединение к шине ввода-вывода или к шине памяти, и от основного метода коммуникаций - с помощью сообщений или разделяемой дисковой памяти.

Из четырех категорий взаимосоединений самыми распространенными являются системы на базе сообщений и с подключением к шине ввода-вывода, поскольку в этом случае интерфейс с компьютером наиболее понятен. Шина ввода-вывода имеет, по крайней мере, аппаратное прерывание, которое может информировать процессор, что данные для чтения готовы. Такие системы реализованы во всех широкодоступных сетевых технологиях, а также в ряде последних продуктов, разработанных специально для кластерных вычислений.

В системы с подключением к шине ввода-вывода и с разделяемой дисковой памятью входят компьютеры с разделяемой дисковой подсистемой. Подсоединение к памяти менее распространено, поскольку шина памяти, вообще говоря, имеет индивидуальный дизайн для каждого типа компьютеров. Однако много таких систем реализуются с помощью ПО или посредством механизма отображения портов ввода-вывода в память, как, например, Memory Channel.

Помимо этого, существуют гибридные системы, которые комбинируют особенности нескольких категорий, скажем, InfiniBand позволяет посылать как данные на диск, так и сообщения другим узлам. Аналогично Scalable Coherent Interface (SCI) может также использовать оба механизма обмена.

Кластерные сети

Системная сеть кластера может быть построена на базе традиционных сетевых продуктов, применяемых в ЛВС, либо спроектирована специально для кластерных вычислений. В последнем случае она обеспечивает дополнительную аппаратную поддержку, которая уменьшает латентность.

Сегодня коммутируемые технологии Ethernet благодаря низкой стоимости портов и стандартизации интерфейсов лидируют в качестве систем взаимосвязи в широкодоступных кластерах. Многие компьютеры оборудуются встроенными портами 1 GE, остается лишь приобрести недорогой коммутатор. Однако при повышенных требованиях используются и специализированные сети. Сколько-нибудь подробное их описание вывело бы нас далеко за пределы возможного, поэтому из соображений полноты приведем лишь весьма конспективные сведения об отдельных из них.

Giganet (cLAN) . Технология cLAN (collapsed LAN), сегодня принадлежащая компании Emulex, была разработана с целью аппаратной поддержки VIA. Это была первая в индустрии нативная аппаратная реализация стандарта VIA. Ключевые особенности сети следующие.

На самом низком уровне коммуникационной модели находится некогерентная распределенная разделяемая память (Distributed Shared Memory, DSM). Часть виртуального адресного пространства приложения логически отображается поверх сети на физическую память в другом узле. Данные передаются между приложениями посредством записи в разделяемую область памяти с помощью стандартных инструкций записи процессора. Буфер в удаленном узле представляется посредством cookie Remote Direct Memory Access, узел-владелец которого получает право доступа к буферу.

Myrinet . Эта дуплексная сеть поставляется компанией Myricom. Она широко используется во многих академических проектах, в частности в Berkeley Network of Workstations (NOW). Физически сеть состоит из двух оптоволоконных кабелей (для нисходящего и восходящего потоков), подключаемых к хосту через общий коннектор. Компьютеры объединяются с помощью маршрутизаторов или коммутаторов (их можно конфигурировать для получения избыточных путей). Поддерживается коммутация без буферизации пакетов (cut-through), которая позволяет передавать сообщения из конца в конец с минимальной задержкой. Myrinet имеет внутриплатный программируемый процессор - он дает возможность экспериментировать со многими коммуникационными протоколами.

В Myrinet реализован ряд механизмов, обеспечивающих отказоустойчивость. К ним относятся управление потоком, контроль ошибок, проверка работоспособности каналов (heartbeat).

Последняя версия, так называемая четвертая генерация Myrinet 10G, поддерживает скорость передачи данных 10 Гб/с в каждом из направлений и совместима с 10 GE на уровне PHY. Латентность сети очень низкая - всего 5 мкс.

QsNet . Эта высокоскоростная с низкой латентностью сеть разработана компанией Quadrics Supercomputers World (QSW). Конструктивно QsNet включает две подсистемы:

  • сетевой интерфейс, состоящий из одного или более сетевых адаптеров в каждом узле;
  • многошинную сеть данных, которая объединяет компьютеры в кластер.

Сетевой интерфейс базируется на заказных микросхемах, именуемых Elan. Модификация Elan III объединяет выделенный процессор ввода-вывода для разгрузки ЦП, шину PCI (66 МГц, 64 бита), дуплексный канал (400 МГц, 8 бит), устройство управления памятью (MMU), кэш и интерфейс локальной памяти. Микросхема выполняет три типа базовых операций:

  • удаленные чтение и запись;
  • прямую передачу данных из пользовательского виртуального адресного пространства одного процессора другому без необходимости синхронизации;
  • управление протоколом.

Сеть конструируется на базе выделенных коммутаторов, которые объединяются в специальном шасси, образуя топологию толстого дерева (чем ветка ближе к корню, тем она толще, т. е. ее пропускная способность выше).

Модификация сети, выпущенная в 2003 г., основана на шине PCI-X 133 МГц и имеет латентность 1,22 мкс.

Scalable Coherent Interface (SCI) . Это первая технология взаимосвязи, разработанная специально для кластерных вычислений, которая была доведена до уровня стандарта. Архитектура SCI базируется на соединениях «точка-точка», пакетах малого размера и расщепленных транзакциях. Стандарт IEEE 1596 был опубликован в 1992 г. и специфицировал физический уровень сети и выше для распределенной по сети разделяемой кэш-когерентной (опциональной) памяти. На более высоких уровнях стандарт описывает распределенную базированную на указателях схему когерентной кэш-памяти. Такая схема позволяет кэшировать удаленную SCI-память: всякий раз, когда данные, расположенные в удаленной памяти, модифицируются, все строки кэша на всех узлах, на которых они хранятся, становятся недействительными. Кэширование удаленной SCI-памяти увеличивает производительность и допускает непосредственное прозрачное программирование разделяемой памяти.

Конечно, это далеко не все технологии, на основе которых можно построить довольно мощный кластер. В кластерах начального уровня, как правило, применяются неспециализированные решения, использующие традиционные сетевые технологии, такие как Ethernet, ATM или Fibre Channel.

Сегодня на рынке представлен широкий спектр кластеров, отличающихся типом и быстродействием процессоров, размером разделяемой узлами памяти, технологией взаимосвязи узлов, моделями и интерфейсами программирования. Однако нужно понимать, что результат, достигаемый с их помощью, в большой степени зависит от особенностей приложений, которые планируется на них развернуть.

Базовый эскиз проекта ОС
Userspace System Processes User Processes
not using
the middleware
User Processes using the middleware
Middleware
System Services User Libraries
Kernel Middleware-related Kernel Extentions
Filesystems / Communication / Programmatic Interface
Memory Manager Scheduler Drivers
Hardware Abstraction Layer
Hardware Resourses Timers & Interrupts
RAM CPUs Disks Network Cluster Interconnect Others